Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE24

Pramef8, 4732496O08Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef8Q8CE24 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pramef8Q8CE24 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pramef8Q8CE24 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pramef8Q8CE24 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pramef8Q8CE24 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pramef8Q8CE24 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pramef8Q8CE24 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pramef8Q8CE24 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pramef8Q8CE24 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pramef8Q8CE24 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pramef8Q8CE24 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pramef8Q8CE24 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pramef8Q8CE24 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pramef8Q8CE24 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pramef8Q8CE24 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pramef8Q8CE24 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pramef8Q8CE24 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pramef8Q8CE24 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pramef8Q8CE24 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pramef8Q8CE24 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pramef8Q8CE24 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pramef8Q8CE24 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pramef8Q8CE24 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pramef8Q8CE24 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pramef8Q8CE24 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pramef8Q8CE24 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pramef8Q8CE24 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pramef8Q8CE24 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pramef8Q8CE24 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pramef8Q8CE24 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pramef8Q8CE24 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pramef8Q8CE24 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pramef8Q8CE24 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pramef8Q8CE24 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pramef8Q8CE24 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pramef8Q8CE24 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pramef8Q8CE24 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pramef8Q8CE24 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pramef8Q8CE24 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pramef8Q8CE24 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pramef8Q8CE24 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pramef8Q8CE24 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pramef8Q8CE24 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pramef8Q8CE24 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pramef8Q8CE24 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pramef8Q8CE24 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pramef8Q8CE24 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pramef8Q8CE24 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pramef8Q8CE24 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pramef8Q8CE24 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pramef8Q8CE24 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pramef8Q8CE24 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pramef8Q8CE24 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pramef8Q8CE24 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Pramef8Q8CE24 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Pramef8Q8CE24 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pramef8Q8CE24 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pramef8Q8CE24 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pramef8Q8CE24 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pramef8Q8CE24 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pramef8Q8CE24 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pramef8Q8CE24 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pramef8Q8CE24 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pramef8Q8CE24 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pramef8Q8CE24 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pramef8Q8CE24 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pramef8Q8CE24 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pramef8Q8CE24 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pramef8Q8CE24 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pramef8Q8CE24 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pramef8Q8CE24 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pramef8Q8CE24 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pramef8Q8CE24 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pramef8Q8CE24 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pramef8Q8CE24 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pramef8Q8CE24 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pramef8Q8CE24 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pramef8Q8CE24 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pramef8Q8CE24 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pramef8Q8CE24 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pramef8Q8CE24 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pramef8Q8CE24 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pramef8Q8CE24 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pramef8Q8CE24 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pramef8Q8CE24 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pramef8Q8CE24 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pramef8Q8CE24 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pramef8Q8CE24 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pramef8Q8CE24 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pramef8Q8CE24 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pramef8Q8CE24 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pramef8Q8CE24 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pramef8Q8CE24 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pramef8Q8CE24 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pramef8Q8CE24 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pramef8Q8CE24 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pramef8Q8CE24 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pramef8Q8CE24 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pramef8Q8CE24 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pramef8Q8CE24 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms