Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE13

Ccdc17, Coiled-coil domain-containing protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc17Q8CE13 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc17Q8CE13 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc17Q8CE13 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc17Q8CE13 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc17Q8CE13 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc17Q8CE13 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc17Q8CE13 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc17Q8CE13 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc17Q8CE13 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc17Q8CE13 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc17Q8CE13 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc17Q8CE13 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc17Q8CE13 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc17Q8CE13 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc17Q8CE13 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc17Q8CE13 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc17Q8CE13 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc17Q8CE13 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc17Q8CE13 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc17Q8CE13 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc17Q8CE13 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc17Q8CE13 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc17Q8CE13 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc17Q8CE13 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc17Q8CE13 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc17Q8CE13 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc17Q8CE13 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc17Q8CE13 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc17Q8CE13 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc17Q8CE13 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc17Q8CE13 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc17Q8CE13 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc17Q8CE13 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc17Q8CE13 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc17Q8CE13 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc17Q8CE13 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc17Q8CE13 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc17Q8CE13 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc17Q8CE13 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc17Q8CE13 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc17Q8CE13 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc17Q8CE13 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc17Q8CE13 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc17Q8CE13 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc17Q8CE13 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc17Q8CE13 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc17Q8CE13 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc17Q8CE13 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc17Q8CE13 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc17Q8CE13 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc17Q8CE13 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc17Q8CE13 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc17Q8CE13 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc17Q8CE13 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ccdc17Q8CE13 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ccdc17Q8CE13 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ccdc17Q8CE13 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc17Q8CE13 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc17Q8CE13 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc17Q8CE13 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc17Q8CE13 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc17Q8CE13 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc17Q8CE13 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc17Q8CE13 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc17Q8CE13 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc17Q8CE13 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc17Q8CE13 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc17Q8CE13 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc17Q8CE13 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc17Q8CE13 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc17Q8CE13 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc17Q8CE13 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc17Q8CE13 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc17Q8CE13 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc17Q8CE13 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc17Q8CE13 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc17Q8CE13 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc17Q8CE13 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc17Q8CE13 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc17Q8CE13 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc17Q8CE13 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc17Q8CE13 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc17Q8CE13 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc17Q8CE13 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc17Q8CE13 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc17Q8CE13 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc17Q8CE13 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc17Q8CE13 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc17Q8CE13 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc17Q8CE13 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc17Q8CE13 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc17Q8CE13 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc17Q8CE13 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc17Q8CE13 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc17Q8CE13 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc17Q8CE13 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc17Q8CE13 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc17Q8CE13 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc17Q8CE13 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc17Q8CE13 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms