Protein–RNA interactions for Protein: Q8CD19

Lancl3, LanC-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lancl3Q8CD19 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lancl3Q8CD19 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lancl3Q8CD19 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lancl3Q8CD19 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lancl3Q8CD19 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lancl3Q8CD19 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lancl3Q8CD19 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lancl3Q8CD19 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lancl3Q8CD19 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lancl3Q8CD19 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Lancl3Q8CD19 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lancl3Q8CD19 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Lancl3Q8CD19 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Lancl3Q8CD19 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lancl3Q8CD19 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Lancl3Q8CD19 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Lancl3Q8CD19 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lancl3Q8CD19 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lancl3Q8CD19 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lancl3Q8CD19 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Lancl3Q8CD19 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lancl3Q8CD19 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lancl3Q8CD19 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lancl3Q8CD19 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lancl3Q8CD19 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lancl3Q8CD19 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lancl3Q8CD19 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lancl3Q8CD19 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lancl3Q8CD19 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lancl3Q8CD19 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Lancl3Q8CD19 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Lancl3Q8CD19 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lancl3Q8CD19 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lancl3Q8CD19 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lancl3Q8CD19 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lancl3Q8CD19 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lancl3Q8CD19 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Lancl3Q8CD19 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lancl3Q8CD19 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lancl3Q8CD19 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lancl3Q8CD19 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lancl3Q8CD19 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lancl3Q8CD19 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lancl3Q8CD19 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Lancl3Q8CD19 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lancl3Q8CD19 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lancl3Q8CD19 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lancl3Q8CD19 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lancl3Q8CD19 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lancl3Q8CD19 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lancl3Q8CD19 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lancl3Q8CD19 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lancl3Q8CD19 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lancl3Q8CD19 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lancl3Q8CD19 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lancl3Q8CD19 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lancl3Q8CD19 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lancl3Q8CD19 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lancl3Q8CD19 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lancl3Q8CD19 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lancl3Q8CD19 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lancl3Q8CD19 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lancl3Q8CD19 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lancl3Q8CD19 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lancl3Q8CD19 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lancl3Q8CD19 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lancl3Q8CD19 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lancl3Q8CD19 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lancl3Q8CD19 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lancl3Q8CD19 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lancl3Q8CD19 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Lancl3Q8CD19 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lancl3Q8CD19 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lancl3Q8CD19 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lancl3Q8CD19 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lancl3Q8CD19 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lancl3Q8CD19 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lancl3Q8CD19 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lancl3Q8CD19 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lancl3Q8CD19 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lancl3Q8CD19 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lancl3Q8CD19 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Lancl3Q8CD19 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lancl3Q8CD19 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lancl3Q8CD19 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lancl3Q8CD19 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lancl3Q8CD19 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lancl3Q8CD19 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lancl3Q8CD19 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lancl3Q8CD19 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lancl3Q8CD19 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lancl3Q8CD19 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lancl3Q8CD19 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lancl3Q8CD19 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Lancl3Q8CD19 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lancl3Q8CD19 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lancl3Q8CD19 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lancl3Q8CD19 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Lancl3Q8CD19 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lancl3Q8CD19 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms