Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBC6

Lrrn3, Leucine-rich repeat neuronal protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrn3Q8CBC6 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lrrn3Q8CBC6 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lrrn3Q8CBC6 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lrrn3Q8CBC6 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lrrn3Q8CBC6 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lrrn3Q8CBC6 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lrrn3Q8CBC6 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lrrn3Q8CBC6 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lrrn3Q8CBC6 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lrrn3Q8CBC6 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lrrn3Q8CBC6 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Lrrn3Q8CBC6 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Lrrn3Q8CBC6 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lrrn3Q8CBC6 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lrrn3Q8CBC6 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lrrn3Q8CBC6 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Lrrn3Q8CBC6 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lrrn3Q8CBC6 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lrrn3Q8CBC6 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lrrn3Q8CBC6 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lrrn3Q8CBC6 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lrrn3Q8CBC6 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lrrn3Q8CBC6 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lrrn3Q8CBC6 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lrrn3Q8CBC6 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lrrn3Q8CBC6 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lrrn3Q8CBC6 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lrrn3Q8CBC6 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lrrn3Q8CBC6 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lrrn3Q8CBC6 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lrrn3Q8CBC6 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lrrn3Q8CBC6 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lrrn3Q8CBC6 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lrrn3Q8CBC6 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lrrn3Q8CBC6 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lrrn3Q8CBC6 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lrrn3Q8CBC6 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lrrn3Q8CBC6 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Lrrn3Q8CBC6 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
Lrrn3Q8CBC6 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Lrrn3Q8CBC6 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrrn3Q8CBC6 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrrn3Q8CBC6 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrrn3Q8CBC6 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrrn3Q8CBC6 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrrn3Q8CBC6 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrrn3Q8CBC6 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrrn3Q8CBC6 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrrn3Q8CBC6 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrrn3Q8CBC6 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrrn3Q8CBC6 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrrn3Q8CBC6 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrrn3Q8CBC6 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrrn3Q8CBC6 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrrn3Q8CBC6 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrrn3Q8CBC6 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrrn3Q8CBC6 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrrn3Q8CBC6 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrrn3Q8CBC6 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrrn3Q8CBC6 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrrn3Q8CBC6 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrrn3Q8CBC6 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrrn3Q8CBC6 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrrn3Q8CBC6 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrrn3Q8CBC6 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrrn3Q8CBC6 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrrn3Q8CBC6 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrrn3Q8CBC6 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lrrn3Q8CBC6 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lrrn3Q8CBC6 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Lrrn3Q8CBC6 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lrrn3Q8CBC6 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lrrn3Q8CBC6 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lrrn3Q8CBC6 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lrrn3Q8CBC6 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lrrn3Q8CBC6 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lrrn3Q8CBC6 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lrrn3Q8CBC6 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Lrrn3Q8CBC6 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lrrn3Q8CBC6 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lrrn3Q8CBC6 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lrrn3Q8CBC6 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lrrn3Q8CBC6 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lrrn3Q8CBC6 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lrrn3Q8CBC6 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lrrn3Q8CBC6 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lrrn3Q8CBC6 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lrrn3Q8CBC6 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lrrn3Q8CBC6 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lrrn3Q8CBC6 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lrrn3Q8CBC6 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lrrn3Q8CBC6 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lrrn3Q8CBC6 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lrrn3Q8CBC6 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lrrn3Q8CBC6 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lrrn3Q8CBC6 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lrrn3Q8CBC6 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lrrn3Q8CBC6 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lrrn3Q8CBC6 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lrrn3Q8CBC6 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms