Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S8

Atg4a, Cysteine protease ATG4A, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4aQ8C9S8 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
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Atg4aQ8C9S8 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
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Atg4aQ8C9S8 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Atg4aQ8C9S8 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
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Atg4aQ8C9S8 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Atg4aQ8C9S8 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Atg4aQ8C9S8 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
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Atg4aQ8C9S8 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Atg4aQ8C9S8 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Atg4aQ8C9S8 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Atg4aQ8C9S8 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
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Atg4aQ8C9S8 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Atg4aQ8C9S8 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
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Atg4aQ8C9S8 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
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Atg4aQ8C9S8 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Atg4aQ8C9S8 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Atg4aQ8C9S8 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Atg4aQ8C9S8 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
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