Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0R9

Lrrd1, Leucine-rich repeat and death domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 853 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrd1Q8C0R9 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lrrd1Q8C0R9 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lrrd1Q8C0R9 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Lrrd1Q8C0R9 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Lrrd1Q8C0R9 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrrd1Q8C0R9 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrrd1Q8C0R9 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrrd1Q8C0R9 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrrd1Q8C0R9 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrrd1Q8C0R9 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrrd1Q8C0R9 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrrd1Q8C0R9 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrrd1Q8C0R9 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrrd1Q8C0R9 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrrd1Q8C0R9 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrrd1Q8C0R9 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrrd1Q8C0R9 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrrd1Q8C0R9 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrrd1Q8C0R9 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
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Lrrd1Q8C0R9 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrrd1Q8C0R9 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrrd1Q8C0R9 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrrd1Q8C0R9 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
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Lrrd1Q8C0R9 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrrd1Q8C0R9 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
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Lrrd1Q8C0R9 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrrd1Q8C0R9 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrrd1Q8C0R9 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrrd1Q8C0R9 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrrd1Q8C0R9 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrrd1Q8C0R9 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrrd1Q8C0R9 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrrd1Q8C0R9 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrrd1Q8C0R9 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
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Lrrd1Q8C0R9 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrrd1Q8C0R9 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
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Lrrd1Q8C0R9 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrrd1Q8C0R9 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
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Lrrd1Q8C0R9 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
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Lrrd1Q8C0R9 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrrd1Q8C0R9 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
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Lrrd1Q8C0R9 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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Lrrd1Q8C0R9 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrrd1Q8C0R9 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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Lrrd1Q8C0R9 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrrd1Q8C0R9 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrrd1Q8C0R9 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrrd1Q8C0R9 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrrd1Q8C0R9 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrrd1Q8C0R9 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrrd1Q8C0R9 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrrd1Q8C0R9 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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Lrrd1Q8C0R9 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
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Lrrd1Q8C0R9 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms