Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTU7

Rccd1, RCC1 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rccd1Q8BTU7 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rccd1Q8BTU7 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rccd1Q8BTU7 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rccd1Q8BTU7 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rccd1Q8BTU7 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rccd1Q8BTU7 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rccd1Q8BTU7 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rccd1Q8BTU7 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rccd1Q8BTU7 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rccd1Q8BTU7 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rccd1Q8BTU7 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rccd1Q8BTU7 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rccd1Q8BTU7 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rccd1Q8BTU7 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rccd1Q8BTU7 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rccd1Q8BTU7 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rccd1Q8BTU7 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rccd1Q8BTU7 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rccd1Q8BTU7 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rccd1Q8BTU7 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rccd1Q8BTU7 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rccd1Q8BTU7 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rccd1Q8BTU7 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Rccd1Q8BTU7 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rccd1Q8BTU7 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rccd1Q8BTU7 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rccd1Q8BTU7 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rccd1Q8BTU7 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rccd1Q8BTU7 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rccd1Q8BTU7 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rccd1Q8BTU7 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rccd1Q8BTU7 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rccd1Q8BTU7 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rccd1Q8BTU7 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Rccd1Q8BTU7 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rccd1Q8BTU7 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rccd1Q8BTU7 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rccd1Q8BTU7 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rccd1Q8BTU7 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rccd1Q8BTU7 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rccd1Q8BTU7 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rccd1Q8BTU7 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rccd1Q8BTU7 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rccd1Q8BTU7 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rccd1Q8BTU7 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rccd1Q8BTU7 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rccd1Q8BTU7 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rccd1Q8BTU7 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rccd1Q8BTU7 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rccd1Q8BTU7 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rccd1Q8BTU7 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rccd1Q8BTU7 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rccd1Q8BTU7 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rccd1Q8BTU7 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rccd1Q8BTU7 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rccd1Q8BTU7 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rccd1Q8BTU7 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rccd1Q8BTU7 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rccd1Q8BTU7 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rccd1Q8BTU7 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rccd1Q8BTU7 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rccd1Q8BTU7 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rccd1Q8BTU7 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rccd1Q8BTU7 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rccd1Q8BTU7 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Rccd1Q8BTU7 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rccd1Q8BTU7 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rccd1Q8BTU7 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rccd1Q8BTU7 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rccd1Q8BTU7 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rccd1Q8BTU7 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rccd1Q8BTU7 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rccd1Q8BTU7 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rccd1Q8BTU7 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rccd1Q8BTU7 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rccd1Q8BTU7 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rccd1Q8BTU7 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Rccd1Q8BTU7 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Rccd1Q8BTU7 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Rccd1Q8BTU7 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Rccd1Q8BTU7 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Rccd1Q8BTU7 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rccd1Q8BTU7 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rccd1Q8BTU7 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rccd1Q8BTU7 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rccd1Q8BTU7 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rccd1Q8BTU7 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rccd1Q8BTU7 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rccd1Q8BTU7 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rccd1Q8BTU7 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rccd1Q8BTU7 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rccd1Q8BTU7 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rccd1Q8BTU7 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rccd1Q8BTU7 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Rccd1Q8BTU7 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rccd1Q8BTU7 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rccd1Q8BTU7 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Rccd1Q8BTU7 Gm44044-201ENSMUST00000205178 1089 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Rccd1Q8BTU7 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rccd1Q8BTU7 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms