Protein–RNA interactions for Protein: Q8BL06

Usp54, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp54Q8BL06 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Usp54Q8BL06 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Usp54Q8BL06 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Usp54Q8BL06 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Usp54Q8BL06 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Usp54Q8BL06 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Usp54Q8BL06 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Usp54Q8BL06 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Usp54Q8BL06 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Usp54Q8BL06 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Usp54Q8BL06 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Usp54Q8BL06 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Usp54Q8BL06 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Usp54Q8BL06 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Usp54Q8BL06 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Usp54Q8BL06 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Usp54Q8BL06 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Usp54Q8BL06 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Usp54Q8BL06 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Usp54Q8BL06 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Usp54Q8BL06 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Usp54Q8BL06 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Usp54Q8BL06 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Usp54Q8BL06 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Usp54Q8BL06 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Usp54Q8BL06 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Usp54Q8BL06 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Usp54Q8BL06 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Usp54Q8BL06 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Usp54Q8BL06 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Usp54Q8BL06 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Usp54Q8BL06 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Usp54Q8BL06 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Usp54Q8BL06 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Usp54Q8BL06 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Usp54Q8BL06 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Usp54Q8BL06 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Usp54Q8BL06 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Usp54Q8BL06 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Usp54Q8BL06 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Usp54Q8BL06 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Usp54Q8BL06 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Usp54Q8BL06 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Usp54Q8BL06 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Usp54Q8BL06 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Usp54Q8BL06 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Usp54Q8BL06 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Usp54Q8BL06 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Usp54Q8BL06 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Usp54Q8BL06 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Usp54Q8BL06 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Usp54Q8BL06 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Usp54Q8BL06 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Usp54Q8BL06 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Usp54Q8BL06 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Usp54Q8BL06 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Usp54Q8BL06 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Usp54Q8BL06 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Usp54Q8BL06 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Usp54Q8BL06 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Usp54Q8BL06 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Usp54Q8BL06 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Usp54Q8BL06 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Usp54Q8BL06 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Usp54Q8BL06 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Usp54Q8BL06 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Usp54Q8BL06 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Usp54Q8BL06 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Usp54Q8BL06 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Usp54Q8BL06 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Usp54Q8BL06 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Usp54Q8BL06 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Usp54Q8BL06 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Usp54Q8BL06 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Usp54Q8BL06 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Usp54Q8BL06 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Usp54Q8BL06 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Usp54Q8BL06 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Usp54Q8BL06 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Usp54Q8BL06 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Usp54Q8BL06 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Usp54Q8BL06 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Usp54Q8BL06 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Usp54Q8BL06 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Usp54Q8BL06 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Usp54Q8BL06 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Usp54Q8BL06 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Usp54Q8BL06 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Usp54Q8BL06 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Usp54Q8BL06 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Usp54Q8BL06 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Usp54Q8BL06 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Usp54Q8BL06 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Usp54Q8BL06 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Usp54Q8BL06 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Usp54Q8BL06 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Usp54Q8BL06 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Usp54Q8BL06 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Usp54Q8BL06 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Usp54Q8BL06 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms