Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKW4

Zcchc4, Zinc finger CCHC domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc4Q8BKW4 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zcchc4Q8BKW4 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zcchc4Q8BKW4 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zcchc4Q8BKW4 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zcchc4Q8BKW4 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zcchc4Q8BKW4 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zcchc4Q8BKW4 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zcchc4Q8BKW4 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zcchc4Q8BKW4 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zcchc4Q8BKW4 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zcchc4Q8BKW4 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zcchc4Q8BKW4 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zcchc4Q8BKW4 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zcchc4Q8BKW4 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zcchc4Q8BKW4 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zcchc4Q8BKW4 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zcchc4Q8BKW4 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zcchc4Q8BKW4 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zcchc4Q8BKW4 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zcchc4Q8BKW4 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Zcchc4Q8BKW4 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zcchc4Q8BKW4 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zcchc4Q8BKW4 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Zcchc4Q8BKW4 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zcchc4Q8BKW4 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zcchc4Q8BKW4 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zcchc4Q8BKW4 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zcchc4Q8BKW4 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zcchc4Q8BKW4 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zcchc4Q8BKW4 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zcchc4Q8BKW4 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zcchc4Q8BKW4 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zcchc4Q8BKW4 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zcchc4Q8BKW4 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zcchc4Q8BKW4 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zcchc4Q8BKW4 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zcchc4Q8BKW4 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zcchc4Q8BKW4 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zcchc4Q8BKW4 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zcchc4Q8BKW4 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zcchc4Q8BKW4 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zcchc4Q8BKW4 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Zcchc4Q8BKW4 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zcchc4Q8BKW4 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zcchc4Q8BKW4 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zcchc4Q8BKW4 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zcchc4Q8BKW4 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zcchc4Q8BKW4 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Zcchc4Q8BKW4 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zcchc4Q8BKW4 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Zcchc4Q8BKW4 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Zcchc4Q8BKW4 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zcchc4Q8BKW4 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zcchc4Q8BKW4 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zcchc4Q8BKW4 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zcchc4Q8BKW4 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zcchc4Q8BKW4 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zcchc4Q8BKW4 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zcchc4Q8BKW4 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zcchc4Q8BKW4 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zcchc4Q8BKW4 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zcchc4Q8BKW4 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zcchc4Q8BKW4 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zcchc4Q8BKW4 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zcchc4Q8BKW4 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zcchc4Q8BKW4 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zcchc4Q8BKW4 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zcchc4Q8BKW4 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zcchc4Q8BKW4 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zcchc4Q8BKW4 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zcchc4Q8BKW4 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zcchc4Q8BKW4 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zcchc4Q8BKW4 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Zcchc4Q8BKW4 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zcchc4Q8BKW4 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zcchc4Q8BKW4 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zcchc4Q8BKW4 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zcchc4Q8BKW4 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zcchc4Q8BKW4 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zcchc4Q8BKW4 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Zcchc4Q8BKW4 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zcchc4Q8BKW4 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zcchc4Q8BKW4 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zcchc4Q8BKW4 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zcchc4Q8BKW4 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zcchc4Q8BKW4 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zcchc4Q8BKW4 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zcchc4Q8BKW4 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zcchc4Q8BKW4 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zcchc4Q8BKW4 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zcchc4Q8BKW4 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zcchc4Q8BKW4 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zcchc4Q8BKW4 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zcchc4Q8BKW4 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zcchc4Q8BKW4 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zcchc4Q8BKW4 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zcchc4Q8BKW4 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zcchc4Q8BKW4 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zcchc4Q8BKW4 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zcchc4Q8BKW4 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms