Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKT7

Thoc5, THO complex subunit 5 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 683 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thoc5Q8BKT7 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Thoc5Q8BKT7 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Thoc5Q8BKT7 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Thoc5Q8BKT7 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Thoc5Q8BKT7 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Thoc5Q8BKT7 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Thoc5Q8BKT7 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Thoc5Q8BKT7 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Thoc5Q8BKT7 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Thoc5Q8BKT7 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Thoc5Q8BKT7 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Thoc5Q8BKT7 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Thoc5Q8BKT7 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Thoc5Q8BKT7 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Thoc5Q8BKT7 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Thoc5Q8BKT7 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Thoc5Q8BKT7 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Thoc5Q8BKT7 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Thoc5Q8BKT7 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Thoc5Q8BKT7 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Thoc5Q8BKT7 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Thoc5Q8BKT7 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Thoc5Q8BKT7 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Thoc5Q8BKT7 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Thoc5Q8BKT7 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Thoc5Q8BKT7 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Thoc5Q8BKT7 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Thoc5Q8BKT7 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Thoc5Q8BKT7 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Thoc5Q8BKT7 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Thoc5Q8BKT7 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Thoc5Q8BKT7 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Thoc5Q8BKT7 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Thoc5Q8BKT7 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Thoc5Q8BKT7 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Thoc5Q8BKT7 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Thoc5Q8BKT7 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Thoc5Q8BKT7 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Thoc5Q8BKT7 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Thoc5Q8BKT7 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Thoc5Q8BKT7 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Thoc5Q8BKT7 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Thoc5Q8BKT7 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Thoc5Q8BKT7 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Thoc5Q8BKT7 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Thoc5Q8BKT7 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Thoc5Q8BKT7 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Thoc5Q8BKT7 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Thoc5Q8BKT7 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Thoc5Q8BKT7 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Thoc5Q8BKT7 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Thoc5Q8BKT7 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Thoc5Q8BKT7 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Thoc5Q8BKT7 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Thoc5Q8BKT7 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Thoc5Q8BKT7 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Thoc5Q8BKT7 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Thoc5Q8BKT7 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Thoc5Q8BKT7 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Thoc5Q8BKT7 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Thoc5Q8BKT7 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Thoc5Q8BKT7 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Thoc5Q8BKT7 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Thoc5Q8BKT7 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Thoc5Q8BKT7 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Thoc5Q8BKT7 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Thoc5Q8BKT7 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Thoc5Q8BKT7 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Thoc5Q8BKT7 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Thoc5Q8BKT7 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Thoc5Q8BKT7 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Thoc5Q8BKT7 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Thoc5Q8BKT7 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Thoc5Q8BKT7 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Thoc5Q8BKT7 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Thoc5Q8BKT7 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Thoc5Q8BKT7 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Thoc5Q8BKT7 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Thoc5Q8BKT7 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Thoc5Q8BKT7 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Thoc5Q8BKT7 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Thoc5Q8BKT7 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Thoc5Q8BKT7 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Thoc5Q8BKT7 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Thoc5Q8BKT7 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Thoc5Q8BKT7 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Thoc5Q8BKT7 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Thoc5Q8BKT7 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Thoc5Q8BKT7 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Thoc5Q8BKT7 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Thoc5Q8BKT7 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Thoc5Q8BKT7 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Thoc5Q8BKT7 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Thoc5Q8BKT7 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Thoc5Q8BKT7 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Thoc5Q8BKT7 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Thoc5Q8BKT7 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Thoc5Q8BKT7 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Thoc5Q8BKT7 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Thoc5Q8BKT7 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms