Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFU0

Rspo2, R-spondin-2, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rspo2Q8BFU0 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rspo2Q8BFU0 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rspo2Q8BFU0 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rspo2Q8BFU0 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rspo2Q8BFU0 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rspo2Q8BFU0 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rspo2Q8BFU0 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rspo2Q8BFU0 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rspo2Q8BFU0 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rspo2Q8BFU0 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rspo2Q8BFU0 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rspo2Q8BFU0 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rspo2Q8BFU0 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rspo2Q8BFU0 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rspo2Q8BFU0 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rspo2Q8BFU0 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rspo2Q8BFU0 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rspo2Q8BFU0 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rspo2Q8BFU0 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rspo2Q8BFU0 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rspo2Q8BFU0 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rspo2Q8BFU0 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rspo2Q8BFU0 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rspo2Q8BFU0 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rspo2Q8BFU0 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rspo2Q8BFU0 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rspo2Q8BFU0 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rspo2Q8BFU0 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rspo2Q8BFU0 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rspo2Q8BFU0 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rspo2Q8BFU0 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rspo2Q8BFU0 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rspo2Q8BFU0 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rspo2Q8BFU0 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rspo2Q8BFU0 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rspo2Q8BFU0 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rspo2Q8BFU0 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rspo2Q8BFU0 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rspo2Q8BFU0 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rspo2Q8BFU0 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rspo2Q8BFU0 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rspo2Q8BFU0 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rspo2Q8BFU0 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rspo2Q8BFU0 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rspo2Q8BFU0 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rspo2Q8BFU0 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rspo2Q8BFU0 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rspo2Q8BFU0 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rspo2Q8BFU0 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rspo2Q8BFU0 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rspo2Q8BFU0 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rspo2Q8BFU0 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rspo2Q8BFU0 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rspo2Q8BFU0 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rspo2Q8BFU0 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rspo2Q8BFU0 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rspo2Q8BFU0 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rspo2Q8BFU0 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rspo2Q8BFU0 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rspo2Q8BFU0 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rspo2Q8BFU0 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rspo2Q8BFU0 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rspo2Q8BFU0 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rspo2Q8BFU0 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Rspo2Q8BFU0 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rspo2Q8BFU0 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rspo2Q8BFU0 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rspo2Q8BFU0 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rspo2Q8BFU0 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rspo2Q8BFU0 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rspo2Q8BFU0 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rspo2Q8BFU0 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rspo2Q8BFU0 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rspo2Q8BFU0 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rspo2Q8BFU0 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rspo2Q8BFU0 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rspo2Q8BFU0 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rspo2Q8BFU0 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rspo2Q8BFU0 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rspo2Q8BFU0 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rspo2Q8BFU0 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rspo2Q8BFU0 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rspo2Q8BFU0 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rspo2Q8BFU0 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rspo2Q8BFU0 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rspo2Q8BFU0 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rspo2Q8BFU0 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rspo2Q8BFU0 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rspo2Q8BFU0 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rspo2Q8BFU0 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rspo2Q8BFU0 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rspo2Q8BFU0 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rspo2Q8BFU0 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rspo2Q8BFU0 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rspo2Q8BFU0 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rspo2Q8BFU0 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rspo2Q8BFU0 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rspo2Q8BFU0 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rspo2Q8BFU0 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rspo2Q8BFU0 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms