Protein–RNA interactions for Protein: Q80XJ3

Ttc28, Tetratricopeptide repeat protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 2,450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc28Q80XJ3 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ttc28Q80XJ3 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ttc28Q80XJ3 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ttc28Q80XJ3 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ttc28Q80XJ3 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ttc28Q80XJ3 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ttc28Q80XJ3 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Ttc28Q80XJ3 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ttc28Q80XJ3 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ttc28Q80XJ3 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ttc28Q80XJ3 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ttc28Q80XJ3 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ttc28Q80XJ3 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ttc28Q80XJ3 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ttc28Q80XJ3 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ttc28Q80XJ3 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ttc28Q80XJ3 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ttc28Q80XJ3 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ttc28Q80XJ3 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ttc28Q80XJ3 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ttc28Q80XJ3 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ttc28Q80XJ3 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ttc28Q80XJ3 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ttc28Q80XJ3 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ttc28Q80XJ3 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ttc28Q80XJ3 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ttc28Q80XJ3 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ttc28Q80XJ3 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ttc28Q80XJ3 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ttc28Q80XJ3 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ttc28Q80XJ3 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ttc28Q80XJ3 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ttc28Q80XJ3 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ttc28Q80XJ3 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ttc28Q80XJ3 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ttc28Q80XJ3 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ttc28Q80XJ3 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ttc28Q80XJ3 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ttc28Q80XJ3 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ttc28Q80XJ3 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ttc28Q80XJ3 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ttc28Q80XJ3 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ttc28Q80XJ3 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ttc28Q80XJ3 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ttc28Q80XJ3 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ttc28Q80XJ3 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ttc28Q80XJ3 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ttc28Q80XJ3 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ttc28Q80XJ3 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ttc28Q80XJ3 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ttc28Q80XJ3 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ttc28Q80XJ3 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ttc28Q80XJ3 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ttc28Q80XJ3 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ttc28Q80XJ3 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ttc28Q80XJ3 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ttc28Q80XJ3 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ttc28Q80XJ3 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ttc28Q80XJ3 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ttc28Q80XJ3 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Ttc28Q80XJ3 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Ttc28Q80XJ3 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ttc28Q80XJ3 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ttc28Q80XJ3 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ttc28Q80XJ3 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ttc28Q80XJ3 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ttc28Q80XJ3 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ttc28Q80XJ3 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ttc28Q80XJ3 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ttc28Q80XJ3 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Ttc28Q80XJ3 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ttc28Q80XJ3 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ttc28Q80XJ3 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ttc28Q80XJ3 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ttc28Q80XJ3 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Ttc28Q80XJ3 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ttc28Q80XJ3 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ttc28Q80XJ3 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ttc28Q80XJ3 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ttc28Q80XJ3 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ttc28Q80XJ3 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ttc28Q80XJ3 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ttc28Q80XJ3 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ttc28Q80XJ3 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Ttc28Q80XJ3 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Ttc28Q80XJ3 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ttc28Q80XJ3 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ttc28Q80XJ3 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ttc28Q80XJ3 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ttc28Q80XJ3 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
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