Protein–RNA interactions for Protein: Q80WQ9

Zbed4, Zinc finger BED domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed4Q80WQ9 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Zbed4Q80WQ9 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zbed4Q80WQ9 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zbed4Q80WQ9 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zbed4Q80WQ9 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zbed4Q80WQ9 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zbed4Q80WQ9 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zbed4Q80WQ9 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zbed4Q80WQ9 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zbed4Q80WQ9 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zbed4Q80WQ9 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zbed4Q80WQ9 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zbed4Q80WQ9 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zbed4Q80WQ9 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zbed4Q80WQ9 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zbed4Q80WQ9 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zbed4Q80WQ9 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zbed4Q80WQ9 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zbed4Q80WQ9 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zbed4Q80WQ9 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zbed4Q80WQ9 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zbed4Q80WQ9 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zbed4Q80WQ9 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zbed4Q80WQ9 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zbed4Q80WQ9 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zbed4Q80WQ9 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zbed4Q80WQ9 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zbed4Q80WQ9 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zbed4Q80WQ9 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zbed4Q80WQ9 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zbed4Q80WQ9 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zbed4Q80WQ9 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zbed4Q80WQ9 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zbed4Q80WQ9 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zbed4Q80WQ9 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Zbed4Q80WQ9 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zbed4Q80WQ9 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zbed4Q80WQ9 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zbed4Q80WQ9 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zbed4Q80WQ9 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zbed4Q80WQ9 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zbed4Q80WQ9 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zbed4Q80WQ9 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zbed4Q80WQ9 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zbed4Q80WQ9 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zbed4Q80WQ9 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zbed4Q80WQ9 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zbed4Q80WQ9 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zbed4Q80WQ9 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Zbed4Q80WQ9 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Zbed4Q80WQ9 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Zbed4Q80WQ9 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zbed4Q80WQ9 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zbed4Q80WQ9 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zbed4Q80WQ9 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zbed4Q80WQ9 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zbed4Q80WQ9 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zbed4Q80WQ9 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Zbed4Q80WQ9 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zbed4Q80WQ9 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zbed4Q80WQ9 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zbed4Q80WQ9 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zbed4Q80WQ9 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zbed4Q80WQ9 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zbed4Q80WQ9 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zbed4Q80WQ9 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zbed4Q80WQ9 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zbed4Q80WQ9 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zbed4Q80WQ9 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zbed4Q80WQ9 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Zbed4Q80WQ9 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zbed4Q80WQ9 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zbed4Q80WQ9 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zbed4Q80WQ9 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zbed4Q80WQ9 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zbed4Q80WQ9 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Zbed4Q80WQ9 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zbed4Q80WQ9 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zbed4Q80WQ9 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zbed4Q80WQ9 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zbed4Q80WQ9 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Zbed4Q80WQ9 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zbed4Q80WQ9 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zbed4Q80WQ9 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zbed4Q80WQ9 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zbed4Q80WQ9 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zbed4Q80WQ9 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zbed4Q80WQ9 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zbed4Q80WQ9 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zbed4Q80WQ9 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zbed4Q80WQ9 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zbed4Q80WQ9 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zbed4Q80WQ9 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zbed4Q80WQ9 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zbed4Q80WQ9 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zbed4Q80WQ9 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zbed4Q80WQ9 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Zbed4Q80WQ9 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zbed4Q80WQ9 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Zbed4Q80WQ9 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms