Protein–RNA interactions for Protein: Q80U56

Avl9, Late secretory pathway protein AVL9 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Avl9Q80U56 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Avl9Q80U56 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Avl9Q80U56 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Avl9Q80U56 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Avl9Q80U56 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Avl9Q80U56 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Avl9Q80U56 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Avl9Q80U56 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Avl9Q80U56 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Avl9Q80U56 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Avl9Q80U56 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Avl9Q80U56 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Avl9Q80U56 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Avl9Q80U56 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Avl9Q80U56 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Avl9Q80U56 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Avl9Q80U56 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Avl9Q80U56 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Avl9Q80U56 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Avl9Q80U56 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Avl9Q80U56 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Avl9Q80U56 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Avl9Q80U56 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Avl9Q80U56 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Avl9Q80U56 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Avl9Q80U56 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Avl9Q80U56 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Avl9Q80U56 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Avl9Q80U56 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Avl9Q80U56 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Avl9Q80U56 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Avl9Q80U56 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Avl9Q80U56 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Avl9Q80U56 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Avl9Q80U56 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Avl9Q80U56 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Avl9Q80U56 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Avl9Q80U56 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Avl9Q80U56 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Avl9Q80U56 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Avl9Q80U56 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Avl9Q80U56 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Avl9Q80U56 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Avl9Q80U56 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Avl9Q80U56 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Avl9Q80U56 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Avl9Q80U56 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Avl9Q80U56 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Avl9Q80U56 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Avl9Q80U56 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Avl9Q80U56 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Avl9Q80U56 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Avl9Q80U56 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Avl9Q80U56 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Avl9Q80U56 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Avl9Q80U56 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Avl9Q80U56 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Avl9Q80U56 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Avl9Q80U56 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Avl9Q80U56 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Avl9Q80U56 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Avl9Q80U56 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Avl9Q80U56 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Avl9Q80U56 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Avl9Q80U56 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Avl9Q80U56 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Avl9Q80U56 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Avl9Q80U56 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Avl9Q80U56 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Avl9Q80U56 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Avl9Q80U56 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Avl9Q80U56 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Avl9Q80U56 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Avl9Q80U56 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Avl9Q80U56 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Avl9Q80U56 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Avl9Q80U56 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Avl9Q80U56 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Avl9Q80U56 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Avl9Q80U56 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Avl9Q80U56 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Avl9Q80U56 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Avl9Q80U56 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Avl9Q80U56 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Avl9Q80U56 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Avl9Q80U56 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Avl9Q80U56 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Avl9Q80U56 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Avl9Q80U56 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Avl9Q80U56 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Avl9Q80U56 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Avl9Q80U56 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Avl9Q80U56 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Avl9Q80U56 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Avl9Q80U56 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Avl9Q80U56 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Avl9Q80U56 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Avl9Q80U56 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Avl9Q80U56 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Avl9Q80U56 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms