Protein–RNA interactions for Protein: Q80U49

Cep170b, Centrosomal protein of 170 kDa protein B, mousemouse

Predictions only

Length 1,574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep170bQ80U49 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cep170bQ80U49 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cep170bQ80U49 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cep170bQ80U49 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cep170bQ80U49 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cep170bQ80U49 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cep170bQ80U49 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cep170bQ80U49 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cep170bQ80U49 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cep170bQ80U49 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cep170bQ80U49 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cep170bQ80U49 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cep170bQ80U49 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cep170bQ80U49 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cep170bQ80U49 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cep170bQ80U49 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cep170bQ80U49 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cep170bQ80U49 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cep170bQ80U49 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Cep170bQ80U49 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cep170bQ80U49 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cep170bQ80U49 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Cep170bQ80U49 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cep170bQ80U49 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cep170bQ80U49 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Cep170bQ80U49 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Cep170bQ80U49 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cep170bQ80U49 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cep170bQ80U49 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cep170bQ80U49 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cep170bQ80U49 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cep170bQ80U49 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cep170bQ80U49 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cep170bQ80U49 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cep170bQ80U49 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cep170bQ80U49 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cep170bQ80U49 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cep170bQ80U49 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cep170bQ80U49 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Cep170bQ80U49 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cep170bQ80U49 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Cep170bQ80U49 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cep170bQ80U49 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cep170bQ80U49 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cep170bQ80U49 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cep170bQ80U49 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cep170bQ80U49 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Cep170bQ80U49 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cep170bQ80U49 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cep170bQ80U49 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cep170bQ80U49 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cep170bQ80U49 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cep170bQ80U49 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cep170bQ80U49 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cep170bQ80U49 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cep170bQ80U49 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cep170bQ80U49 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cep170bQ80U49 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cep170bQ80U49 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cep170bQ80U49 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cep170bQ80U49 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cep170bQ80U49 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cep170bQ80U49 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cep170bQ80U49 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cep170bQ80U49 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cep170bQ80U49 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cep170bQ80U49 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cep170bQ80U49 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cep170bQ80U49 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cep170bQ80U49 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cep170bQ80U49 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cep170bQ80U49 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cep170bQ80U49 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cep170bQ80U49 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cep170bQ80U49 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cep170bQ80U49 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Cep170bQ80U49 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Cep170bQ80U49 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cep170bQ80U49 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cep170bQ80U49 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cep170bQ80U49 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cep170bQ80U49 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cep170bQ80U49 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cep170bQ80U49 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cep170bQ80U49 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cep170bQ80U49 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cep170bQ80U49 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cep170bQ80U49 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cep170bQ80U49 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cep170bQ80U49 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cep170bQ80U49 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cep170bQ80U49 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cep170bQ80U49 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cep170bQ80U49 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cep170bQ80U49 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cep170bQ80U49 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cep170bQ80U49 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cep170bQ80U49 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cep170bQ80U49 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cep170bQ80U49 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms