Protein–RNA interactions for Protein: Q7TT50

Cdc42bpb, Serine/threonine-protein kinase MRCK beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,713 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc42bpbQ7TT50 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cdc42bpbQ7TT50 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cdc42bpbQ7TT50 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cdc42bpbQ7TT50 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cdc42bpbQ7TT50 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cdc42bpbQ7TT50 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cdc42bpbQ7TT50 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cdc42bpbQ7TT50 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cdc42bpbQ7TT50 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cdc42bpbQ7TT50 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cdc42bpbQ7TT50 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cdc42bpbQ7TT50 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cdc42bpbQ7TT50 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cdc42bpbQ7TT50 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cdc42bpbQ7TT50 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cdc42bpbQ7TT50 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cdc42bpbQ7TT50 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cdc42bpbQ7TT50 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cdc42bpbQ7TT50 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cdc42bpbQ7TT50 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cdc42bpbQ7TT50 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cdc42bpbQ7TT50 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cdc42bpbQ7TT50 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cdc42bpbQ7TT50 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cdc42bpbQ7TT50 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cdc42bpbQ7TT50 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cdc42bpbQ7TT50 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cdc42bpbQ7TT50 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cdc42bpbQ7TT50 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cdc42bpbQ7TT50 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cdc42bpbQ7TT50 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cdc42bpbQ7TT50 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cdc42bpbQ7TT50 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cdc42bpbQ7TT50 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cdc42bpbQ7TT50 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cdc42bpbQ7TT50 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cdc42bpbQ7TT50 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cdc42bpbQ7TT50 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cdc42bpbQ7TT50 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Cdc42bpbQ7TT50 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cdc42bpbQ7TT50 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cdc42bpbQ7TT50 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cdc42bpbQ7TT50 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cdc42bpbQ7TT50 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cdc42bpbQ7TT50 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Cdc42bpbQ7TT50 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cdc42bpbQ7TT50 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cdc42bpbQ7TT50 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cdc42bpbQ7TT50 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cdc42bpbQ7TT50 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cdc42bpbQ7TT50 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cdc42bpbQ7TT50 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cdc42bpbQ7TT50 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cdc42bpbQ7TT50 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cdc42bpbQ7TT50 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cdc42bpbQ7TT50 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cdc42bpbQ7TT50 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cdc42bpbQ7TT50 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cdc42bpbQ7TT50 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cdc42bpbQ7TT50 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cdc42bpbQ7TT50 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cdc42bpbQ7TT50 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Cdc42bpbQ7TT50 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Cdc42bpbQ7TT50 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cdc42bpbQ7TT50 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cdc42bpbQ7TT50 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cdc42bpbQ7TT50 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cdc42bpbQ7TT50 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cdc42bpbQ7TT50 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cdc42bpbQ7TT50 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cdc42bpbQ7TT50 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cdc42bpbQ7TT50 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cdc42bpbQ7TT50 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cdc42bpbQ7TT50 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cdc42bpbQ7TT50 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cdc42bpbQ7TT50 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cdc42bpbQ7TT50 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Cdc42bpbQ7TT50 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cdc42bpbQ7TT50 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cdc42bpbQ7TT50 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Cdc42bpbQ7TT50 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cdc42bpbQ7TT50 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cdc42bpbQ7TT50 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cdc42bpbQ7TT50 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cdc42bpbQ7TT50 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cdc42bpbQ7TT50 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Cdc42bpbQ7TT50 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cdc42bpbQ7TT50 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cdc42bpbQ7TT50 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cdc42bpbQ7TT50 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Cdc42bpbQ7TT50 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Cdc42bpbQ7TT50 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cdc42bpbQ7TT50 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cdc42bpbQ7TT50 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cdc42bpbQ7TT50 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cdc42bpbQ7TT50 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cdc42bpbQ7TT50 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cdc42bpbQ7TT50 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cdc42bpbQ7TT50 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cdc42bpbQ7TT50 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms