Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSY8

Sgo2, Shugoshin 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo2Q7TSY8 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sgo2Q7TSY8 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sgo2Q7TSY8 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Sgo2Q7TSY8 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Sgo2Q7TSY8 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sgo2Q7TSY8 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Sgo2Q7TSY8 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sgo2Q7TSY8 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sgo2Q7TSY8 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sgo2Q7TSY8 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sgo2Q7TSY8 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sgo2Q7TSY8 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sgo2Q7TSY8 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sgo2Q7TSY8 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sgo2Q7TSY8 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sgo2Q7TSY8 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sgo2Q7TSY8 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sgo2Q7TSY8 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sgo2Q7TSY8 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sgo2Q7TSY8 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sgo2Q7TSY8 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sgo2Q7TSY8 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sgo2Q7TSY8 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sgo2Q7TSY8 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sgo2Q7TSY8 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sgo2Q7TSY8 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sgo2Q7TSY8 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sgo2Q7TSY8 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sgo2Q7TSY8 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sgo2Q7TSY8 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sgo2Q7TSY8 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sgo2Q7TSY8 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sgo2Q7TSY8 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sgo2Q7TSY8 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sgo2Q7TSY8 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Sgo2Q7TSY8 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sgo2Q7TSY8 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sgo2Q7TSY8 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sgo2Q7TSY8 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sgo2Q7TSY8 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sgo2Q7TSY8 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sgo2Q7TSY8 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sgo2Q7TSY8 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sgo2Q7TSY8 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sgo2Q7TSY8 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sgo2Q7TSY8 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sgo2Q7TSY8 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sgo2Q7TSY8 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Sgo2Q7TSY8 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sgo2Q7TSY8 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sgo2Q7TSY8 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sgo2Q7TSY8 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sgo2Q7TSY8 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sgo2Q7TSY8 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sgo2Q7TSY8 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sgo2Q7TSY8 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sgo2Q7TSY8 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Sgo2Q7TSY8 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sgo2Q7TSY8 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sgo2Q7TSY8 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sgo2Q7TSY8 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sgo2Q7TSY8 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sgo2Q7TSY8 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sgo2Q7TSY8 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sgo2Q7TSY8 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sgo2Q7TSY8 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sgo2Q7TSY8 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sgo2Q7TSY8 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sgo2Q7TSY8 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sgo2Q7TSY8 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sgo2Q7TSY8 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sgo2Q7TSY8 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sgo2Q7TSY8 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Sgo2Q7TSY8 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sgo2Q7TSY8 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sgo2Q7TSY8 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Sgo2Q7TSY8 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sgo2Q7TSY8 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sgo2Q7TSY8 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sgo2Q7TSY8 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sgo2Q7TSY8 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sgo2Q7TSY8 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Sgo2Q7TSY8 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sgo2Q7TSY8 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sgo2Q7TSY8 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sgo2Q7TSY8 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sgo2Q7TSY8 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sgo2Q7TSY8 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sgo2Q7TSY8 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sgo2Q7TSY8 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sgo2Q7TSY8 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Sgo2Q7TSY8 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sgo2Q7TSY8 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sgo2Q7TSY8 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sgo2Q7TSY8 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sgo2Q7TSY8 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sgo2Q7TSY8 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sgo2Q7TSY8 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sgo2Q7TSY8 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sgo2Q7TSY8 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms