Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPM1

Prrc2b, Protein PRRC2B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrc2bQ7TPM1 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Prrc2bQ7TPM1 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Prrc2bQ7TPM1 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Prrc2bQ7TPM1 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Prrc2bQ7TPM1 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Prrc2bQ7TPM1 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Prrc2bQ7TPM1 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Prrc2bQ7TPM1 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Prrc2bQ7TPM1 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Prrc2bQ7TPM1 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Prrc2bQ7TPM1 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Prrc2bQ7TPM1 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Prrc2bQ7TPM1 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Prrc2bQ7TPM1 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Prrc2bQ7TPM1 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Prrc2bQ7TPM1 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Prrc2bQ7TPM1 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Prrc2bQ7TPM1 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Prrc2bQ7TPM1 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Prrc2bQ7TPM1 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Prrc2bQ7TPM1 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
Prrc2bQ7TPM1 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Prrc2bQ7TPM1 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Prrc2bQ7TPM1 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Prrc2bQ7TPM1 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
Prrc2bQ7TPM1 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Prrc2bQ7TPM1 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Prrc2bQ7TPM1 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Prrc2bQ7TPM1 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Prrc2bQ7TPM1 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Prrc2bQ7TPM1 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Prrc2bQ7TPM1 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Prrc2bQ7TPM1 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Prrc2bQ7TPM1 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Prrc2bQ7TPM1 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Prrc2bQ7TPM1 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Prrc2bQ7TPM1 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Prrc2bQ7TPM1 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Prrc2bQ7TPM1 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Prrc2bQ7TPM1 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Prrc2bQ7TPM1 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Prrc2bQ7TPM1 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Prrc2bQ7TPM1 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Prrc2bQ7TPM1 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Prrc2bQ7TPM1 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Prrc2bQ7TPM1 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Prrc2bQ7TPM1 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Prrc2bQ7TPM1 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Prrc2bQ7TPM1 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Prrc2bQ7TPM1 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Prrc2bQ7TPM1 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Prrc2bQ7TPM1 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Prrc2bQ7TPM1 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Prrc2bQ7TPM1 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Prrc2bQ7TPM1 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Prrc2bQ7TPM1 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Prrc2bQ7TPM1 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Prrc2bQ7TPM1 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Prrc2bQ7TPM1 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Prrc2bQ7TPM1 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Prrc2bQ7TPM1 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Prrc2bQ7TPM1 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Prrc2bQ7TPM1 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Prrc2bQ7TPM1 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Prrc2bQ7TPM1 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Prrc2bQ7TPM1 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Prrc2bQ7TPM1 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Prrc2bQ7TPM1 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Prrc2bQ7TPM1 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Prrc2bQ7TPM1 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Prrc2bQ7TPM1 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Prrc2bQ7TPM1 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Prrc2bQ7TPM1 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Prrc2bQ7TPM1 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Prrc2bQ7TPM1 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Prrc2bQ7TPM1 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Prrc2bQ7TPM1 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Prrc2bQ7TPM1 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Prrc2bQ7TPM1 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Prrc2bQ7TPM1 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Prrc2bQ7TPM1 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Prrc2bQ7TPM1 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Prrc2bQ7TPM1 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Prrc2bQ7TPM1 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Prrc2bQ7TPM1 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Prrc2bQ7TPM1 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Prrc2bQ7TPM1 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Prrc2bQ7TPM1 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Prrc2bQ7TPM1 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Prrc2bQ7TPM1 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Prrc2bQ7TPM1 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Prrc2bQ7TPM1 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Prrc2bQ7TPM1 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Prrc2bQ7TPM1 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Prrc2bQ7TPM1 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Prrc2bQ7TPM1 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Prrc2bQ7TPM1 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Prrc2bQ7TPM1 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Prrc2bQ7TPM1 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Prrc2bQ7TPM1 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms