Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPH6

Mycbp2, E3 ubiquitin-protein ligase MYCBP2, mousemouse

Predictions only

Length 4,711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mycbp2Q7TPH6 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Mycbp2Q7TPH6 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Mycbp2Q7TPH6 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Mycbp2Q7TPH6 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Mycbp2Q7TPH6 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Mycbp2Q7TPH6 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Mycbp2Q7TPH6 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Mycbp2Q7TPH6 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Mycbp2Q7TPH6 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Mycbp2Q7TPH6 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Mycbp2Q7TPH6 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Mycbp2Q7TPH6 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Mycbp2Q7TPH6 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Mycbp2Q7TPH6 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Mycbp2Q7TPH6 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Mycbp2Q7TPH6 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Mycbp2Q7TPH6 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Mycbp2Q7TPH6 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Mycbp2Q7TPH6 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Mycbp2Q7TPH6 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Mycbp2Q7TPH6 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Mycbp2Q7TPH6 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Mycbp2Q7TPH6 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Mycbp2Q7TPH6 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Mycbp2Q7TPH6 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Mycbp2Q7TPH6 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Mycbp2Q7TPH6 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Mycbp2Q7TPH6 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Mycbp2Q7TPH6 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Mycbp2Q7TPH6 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Mycbp2Q7TPH6 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Mycbp2Q7TPH6 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Mycbp2Q7TPH6 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Mycbp2Q7TPH6 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Mycbp2Q7TPH6 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Mycbp2Q7TPH6 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Mycbp2Q7TPH6 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Mycbp2Q7TPH6 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Mycbp2Q7TPH6 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Mycbp2Q7TPH6 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Mycbp2Q7TPH6 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Mycbp2Q7TPH6 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Mycbp2Q7TPH6 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Mycbp2Q7TPH6 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Mycbp2Q7TPH6 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Mycbp2Q7TPH6 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Mycbp2Q7TPH6 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Mycbp2Q7TPH6 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Mycbp2Q7TPH6 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Mycbp2Q7TPH6 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Mycbp2Q7TPH6 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Mycbp2Q7TPH6 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Mycbp2Q7TPH6 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Mycbp2Q7TPH6 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Mycbp2Q7TPH6 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Mycbp2Q7TPH6 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Mycbp2Q7TPH6 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Mycbp2Q7TPH6 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Mycbp2Q7TPH6 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Mycbp2Q7TPH6 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Mycbp2Q7TPH6 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Mycbp2Q7TPH6 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Mycbp2Q7TPH6 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Mycbp2Q7TPH6 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Mycbp2Q7TPH6 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Mycbp2Q7TPH6 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Mycbp2Q7TPH6 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Mycbp2Q7TPH6 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Mycbp2Q7TPH6 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Mycbp2Q7TPH6 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Mycbp2Q7TPH6 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC9.46□□□□□ -0.89
Mycbp2Q7TPH6 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Mycbp2Q7TPH6 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Mycbp2Q7TPH6 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC9.46□□□□□ -0.89
Mycbp2Q7TPH6 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC9.46□□□□□ -0.89
Mycbp2Q7TPH6 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
Mycbp2Q7TPH6 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
Mycbp2Q7TPH6 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
Mycbp2Q7TPH6 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC9.46□□□□□ -0.89
Mycbp2Q7TPH6 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Mycbp2Q7TPH6 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Mycbp2Q7TPH6 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Mycbp2Q7TPH6 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Mycbp2Q7TPH6 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Mycbp2Q7TPH6 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Mycbp2Q7TPH6 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
Mycbp2Q7TPH6 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Mycbp2Q7TPH6 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Mycbp2Q7TPH6 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC9.46□□□□□ -0.89
Mycbp2Q7TPH6 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Mycbp2Q7TPH6 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Mycbp2Q7TPH6 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Mycbp2Q7TPH6 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Mycbp2Q7TPH6 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Mycbp2Q7TPH6 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Mycbp2Q7TPH6 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Mycbp2Q7TPH6 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Mycbp2Q7TPH6 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Mycbp2Q7TPH6 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Mycbp2Q7TPH6 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.6 ms