Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNB8

Sbno2, Protein strawberry notch homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbno2Q7TNB8 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sbno2Q7TNB8 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sbno2Q7TNB8 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sbno2Q7TNB8 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sbno2Q7TNB8 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sbno2Q7TNB8 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sbno2Q7TNB8 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sbno2Q7TNB8 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sbno2Q7TNB8 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sbno2Q7TNB8 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sbno2Q7TNB8 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sbno2Q7TNB8 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Sbno2Q7TNB8 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Sbno2Q7TNB8 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Sbno2Q7TNB8 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sbno2Q7TNB8 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Sbno2Q7TNB8 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Sbno2Q7TNB8 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sbno2Q7TNB8 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sbno2Q7TNB8 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sbno2Q7TNB8 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sbno2Q7TNB8 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sbno2Q7TNB8 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sbno2Q7TNB8 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sbno2Q7TNB8 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sbno2Q7TNB8 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sbno2Q7TNB8 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sbno2Q7TNB8 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sbno2Q7TNB8 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sbno2Q7TNB8 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sbno2Q7TNB8 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sbno2Q7TNB8 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sbno2Q7TNB8 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sbno2Q7TNB8 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sbno2Q7TNB8 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sbno2Q7TNB8 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Sbno2Q7TNB8 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sbno2Q7TNB8 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sbno2Q7TNB8 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sbno2Q7TNB8 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sbno2Q7TNB8 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sbno2Q7TNB8 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sbno2Q7TNB8 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sbno2Q7TNB8 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sbno2Q7TNB8 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sbno2Q7TNB8 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Sbno2Q7TNB8 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sbno2Q7TNB8 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sbno2Q7TNB8 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sbno2Q7TNB8 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Sbno2Q7TNB8 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sbno2Q7TNB8 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sbno2Q7TNB8 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Sbno2Q7TNB8 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sbno2Q7TNB8 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sbno2Q7TNB8 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sbno2Q7TNB8 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sbno2Q7TNB8 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sbno2Q7TNB8 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sbno2Q7TNB8 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sbno2Q7TNB8 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sbno2Q7TNB8 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sbno2Q7TNB8 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sbno2Q7TNB8 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sbno2Q7TNB8 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sbno2Q7TNB8 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sbno2Q7TNB8 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sbno2Q7TNB8 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sbno2Q7TNB8 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sbno2Q7TNB8 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sbno2Q7TNB8 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sbno2Q7TNB8 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sbno2Q7TNB8 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sbno2Q7TNB8 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sbno2Q7TNB8 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sbno2Q7TNB8 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sbno2Q7TNB8 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sbno2Q7TNB8 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sbno2Q7TNB8 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sbno2Q7TNB8 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sbno2Q7TNB8 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Sbno2Q7TNB8 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sbno2Q7TNB8 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sbno2Q7TNB8 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sbno2Q7TNB8 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sbno2Q7TNB8 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sbno2Q7TNB8 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sbno2Q7TNB8 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sbno2Q7TNB8 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sbno2Q7TNB8 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sbno2Q7TNB8 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sbno2Q7TNB8 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sbno2Q7TNB8 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sbno2Q7TNB8 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sbno2Q7TNB8 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sbno2Q7TNB8 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sbno2Q7TNB8 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sbno2Q7TNB8 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sbno2Q7TNB8 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sbno2Q7TNB8 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms