Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMV1

Rnf139, E3 ubiquitin-protein ligase RNF139, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf139Q7TMV1 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rnf139Q7TMV1 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rnf139Q7TMV1 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rnf139Q7TMV1 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rnf139Q7TMV1 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rnf139Q7TMV1 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rnf139Q7TMV1 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rnf139Q7TMV1 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rnf139Q7TMV1 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rnf139Q7TMV1 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rnf139Q7TMV1 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rnf139Q7TMV1 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rnf139Q7TMV1 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rnf139Q7TMV1 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rnf139Q7TMV1 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rnf139Q7TMV1 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rnf139Q7TMV1 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rnf139Q7TMV1 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rnf139Q7TMV1 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rnf139Q7TMV1 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rnf139Q7TMV1 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rnf139Q7TMV1 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rnf139Q7TMV1 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rnf139Q7TMV1 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rnf139Q7TMV1 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rnf139Q7TMV1 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rnf139Q7TMV1 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rnf139Q7TMV1 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rnf139Q7TMV1 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rnf139Q7TMV1 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rnf139Q7TMV1 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rnf139Q7TMV1 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rnf139Q7TMV1 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rnf139Q7TMV1 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rnf139Q7TMV1 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rnf139Q7TMV1 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rnf139Q7TMV1 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rnf139Q7TMV1 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rnf139Q7TMV1 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rnf139Q7TMV1 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rnf139Q7TMV1 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rnf139Q7TMV1 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rnf139Q7TMV1 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rnf139Q7TMV1 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rnf139Q7TMV1 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rnf139Q7TMV1 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rnf139Q7TMV1 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Rnf139Q7TMV1 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rnf139Q7TMV1 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rnf139Q7TMV1 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rnf139Q7TMV1 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rnf139Q7TMV1 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rnf139Q7TMV1 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rnf139Q7TMV1 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rnf139Q7TMV1 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rnf139Q7TMV1 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rnf139Q7TMV1 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rnf139Q7TMV1 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rnf139Q7TMV1 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rnf139Q7TMV1 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rnf139Q7TMV1 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rnf139Q7TMV1 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rnf139Q7TMV1 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rnf139Q7TMV1 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rnf139Q7TMV1 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rnf139Q7TMV1 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Rnf139Q7TMV1 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rnf139Q7TMV1 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rnf139Q7TMV1 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rnf139Q7TMV1 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rnf139Q7TMV1 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rnf139Q7TMV1 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rnf139Q7TMV1 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rnf139Q7TMV1 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rnf139Q7TMV1 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rnf139Q7TMV1 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rnf139Q7TMV1 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rnf139Q7TMV1 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Rnf139Q7TMV1 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rnf139Q7TMV1 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rnf139Q7TMV1 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rnf139Q7TMV1 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rnf139Q7TMV1 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rnf139Q7TMV1 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rnf139Q7TMV1 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rnf139Q7TMV1 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Rnf139Q7TMV1 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rnf139Q7TMV1 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Rnf139Q7TMV1 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Rnf139Q7TMV1 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Rnf139Q7TMV1 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rnf139Q7TMV1 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rnf139Q7TMV1 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rnf139Q7TMV1 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rnf139Q7TMV1 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rnf139Q7TMV1 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rnf139Q7TMV1 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rnf139Q7TMV1 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rnf139Q7TMV1 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rnf139Q7TMV1 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms