Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMK9

Syncrip, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein Q, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SyncripQ7TMK9 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SyncripQ7TMK9 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SyncripQ7TMK9 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SyncripQ7TMK9 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SyncripQ7TMK9 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SyncripQ7TMK9 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SyncripQ7TMK9 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SyncripQ7TMK9 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SyncripQ7TMK9 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SyncripQ7TMK9 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SyncripQ7TMK9 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SyncripQ7TMK9 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SyncripQ7TMK9 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SyncripQ7TMK9 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SyncripQ7TMK9 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SyncripQ7TMK9 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SyncripQ7TMK9 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SyncripQ7TMK9 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SyncripQ7TMK9 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SyncripQ7TMK9 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SyncripQ7TMK9 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SyncripQ7TMK9 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SyncripQ7TMK9 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SyncripQ7TMK9 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SyncripQ7TMK9 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SyncripQ7TMK9 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SyncripQ7TMK9 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SyncripQ7TMK9 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SyncripQ7TMK9 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SyncripQ7TMK9 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SyncripQ7TMK9 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SyncripQ7TMK9 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SyncripQ7TMK9 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SyncripQ7TMK9 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SyncripQ7TMK9 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SyncripQ7TMK9 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SyncripQ7TMK9 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SyncripQ7TMK9 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SyncripQ7TMK9 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SyncripQ7TMK9 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SyncripQ7TMK9 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SyncripQ7TMK9 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SyncripQ7TMK9 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SyncripQ7TMK9 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SyncripQ7TMK9 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SyncripQ7TMK9 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SyncripQ7TMK9 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SyncripQ7TMK9 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SyncripQ7TMK9 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SyncripQ7TMK9 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SyncripQ7TMK9 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SyncripQ7TMK9 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SyncripQ7TMK9 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SyncripQ7TMK9 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SyncripQ7TMK9 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SyncripQ7TMK9 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SyncripQ7TMK9 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SyncripQ7TMK9 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SyncripQ7TMK9 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SyncripQ7TMK9 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SyncripQ7TMK9 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SyncripQ7TMK9 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SyncripQ7TMK9 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SyncripQ7TMK9 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SyncripQ7TMK9 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SyncripQ7TMK9 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SyncripQ7TMK9 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SyncripQ7TMK9 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SyncripQ7TMK9 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SyncripQ7TMK9 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SyncripQ7TMK9 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SyncripQ7TMK9 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SyncripQ7TMK9 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SyncripQ7TMK9 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SyncripQ7TMK9 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SyncripQ7TMK9 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SyncripQ7TMK9 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SyncripQ7TMK9 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SyncripQ7TMK9 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SyncripQ7TMK9 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SyncripQ7TMK9 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SyncripQ7TMK9 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SyncripQ7TMK9 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SyncripQ7TMK9 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SyncripQ7TMK9 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SyncripQ7TMK9 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SyncripQ7TMK9 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SyncripQ7TMK9 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SyncripQ7TMK9 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SyncripQ7TMK9 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SyncripQ7TMK9 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SyncripQ7TMK9 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SyncripQ7TMK9 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SyncripQ7TMK9 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SyncripQ7TMK9 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SyncripQ7TMK9 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SyncripQ7TMK9 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SyncripQ7TMK9 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SyncripQ7TMK9 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SyncripQ7TMK9 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms