Protein–RNA interactions for Protein: Q7TM95

Tigd3, Tigger transposable element-derived protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tigd3Q7TM95 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Tigd3Q7TM95 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tigd3Q7TM95 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tigd3Q7TM95 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tigd3Q7TM95 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tigd3Q7TM95 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tigd3Q7TM95 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tigd3Q7TM95 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tigd3Q7TM95 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tigd3Q7TM95 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tigd3Q7TM95 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tigd3Q7TM95 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Tigd3Q7TM95 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tigd3Q7TM95 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tigd3Q7TM95 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tigd3Q7TM95 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tigd3Q7TM95 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tigd3Q7TM95 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Tigd3Q7TM95 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tigd3Q7TM95 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tigd3Q7TM95 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tigd3Q7TM95 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tigd3Q7TM95 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tigd3Q7TM95 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tigd3Q7TM95 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tigd3Q7TM95 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tigd3Q7TM95 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tigd3Q7TM95 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tigd3Q7TM95 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tigd3Q7TM95 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tigd3Q7TM95 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tigd3Q7TM95 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tigd3Q7TM95 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tigd3Q7TM95 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tigd3Q7TM95 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tigd3Q7TM95 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tigd3Q7TM95 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tigd3Q7TM95 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tigd3Q7TM95 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tigd3Q7TM95 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tigd3Q7TM95 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tigd3Q7TM95 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tigd3Q7TM95 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tigd3Q7TM95 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tigd3Q7TM95 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tigd3Q7TM95 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tigd3Q7TM95 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tigd3Q7TM95 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tigd3Q7TM95 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tigd3Q7TM95 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tigd3Q7TM95 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tigd3Q7TM95 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tigd3Q7TM95 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tigd3Q7TM95 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tigd3Q7TM95 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tigd3Q7TM95 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tigd3Q7TM95 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Tigd3Q7TM95 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Tigd3Q7TM95 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Tigd3Q7TM95 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tigd3Q7TM95 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tigd3Q7TM95 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tigd3Q7TM95 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tigd3Q7TM95 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tigd3Q7TM95 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tigd3Q7TM95 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tigd3Q7TM95 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tigd3Q7TM95 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tigd3Q7TM95 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tigd3Q7TM95 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tigd3Q7TM95 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tigd3Q7TM95 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tigd3Q7TM95 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tigd3Q7TM95 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Tigd3Q7TM95 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Tigd3Q7TM95 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tigd3Q7TM95 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tigd3Q7TM95 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tigd3Q7TM95 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tigd3Q7TM95 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tigd3Q7TM95 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tigd3Q7TM95 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tigd3Q7TM95 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tigd3Q7TM95 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Tigd3Q7TM95 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tigd3Q7TM95 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Tigd3Q7TM95 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tigd3Q7TM95 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Tigd3Q7TM95 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tigd3Q7TM95 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tigd3Q7TM95 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tigd3Q7TM95 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tigd3Q7TM95 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tigd3Q7TM95 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tigd3Q7TM95 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tigd3Q7TM95 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tigd3Q7TM95 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tigd3Q7TM95 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tigd3Q7TM95 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tigd3Q7TM95 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms