Protein–RNA interactions for Protein: Q78WZ7

Twistnb, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TwistnbQ78WZ7 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TwistnbQ78WZ7 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TwistnbQ78WZ7 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TwistnbQ78WZ7 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TwistnbQ78WZ7 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TwistnbQ78WZ7 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TwistnbQ78WZ7 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
TwistnbQ78WZ7 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TwistnbQ78WZ7 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TwistnbQ78WZ7 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TwistnbQ78WZ7 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TwistnbQ78WZ7 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TwistnbQ78WZ7 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
TwistnbQ78WZ7 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TwistnbQ78WZ7 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TwistnbQ78WZ7 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TwistnbQ78WZ7 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TwistnbQ78WZ7 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TwistnbQ78WZ7 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TwistnbQ78WZ7 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TwistnbQ78WZ7 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TwistnbQ78WZ7 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TwistnbQ78WZ7 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TwistnbQ78WZ7 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TwistnbQ78WZ7 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TwistnbQ78WZ7 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TwistnbQ78WZ7 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TwistnbQ78WZ7 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TwistnbQ78WZ7 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TwistnbQ78WZ7 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TwistnbQ78WZ7 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TwistnbQ78WZ7 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TwistnbQ78WZ7 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TwistnbQ78WZ7 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TwistnbQ78WZ7 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
TwistnbQ78WZ7 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TwistnbQ78WZ7 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TwistnbQ78WZ7 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TwistnbQ78WZ7 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TwistnbQ78WZ7 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TwistnbQ78WZ7 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TwistnbQ78WZ7 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TwistnbQ78WZ7 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TwistnbQ78WZ7 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TwistnbQ78WZ7 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TwistnbQ78WZ7 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TwistnbQ78WZ7 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TwistnbQ78WZ7 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
TwistnbQ78WZ7 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TwistnbQ78WZ7 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TwistnbQ78WZ7 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TwistnbQ78WZ7 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
TwistnbQ78WZ7 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TwistnbQ78WZ7 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
TwistnbQ78WZ7 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
TwistnbQ78WZ7 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TwistnbQ78WZ7 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TwistnbQ78WZ7 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TwistnbQ78WZ7 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TwistnbQ78WZ7 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TwistnbQ78WZ7 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TwistnbQ78WZ7 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TwistnbQ78WZ7 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TwistnbQ78WZ7 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TwistnbQ78WZ7 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TwistnbQ78WZ7 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TwistnbQ78WZ7 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TwistnbQ78WZ7 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TwistnbQ78WZ7 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TwistnbQ78WZ7 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TwistnbQ78WZ7 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TwistnbQ78WZ7 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TwistnbQ78WZ7 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TwistnbQ78WZ7 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TwistnbQ78WZ7 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
TwistnbQ78WZ7 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
TwistnbQ78WZ7 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
TwistnbQ78WZ7 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TwistnbQ78WZ7 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TwistnbQ78WZ7 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TwistnbQ78WZ7 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TwistnbQ78WZ7 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TwistnbQ78WZ7 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TwistnbQ78WZ7 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TwistnbQ78WZ7 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TwistnbQ78WZ7 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TwistnbQ78WZ7 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TwistnbQ78WZ7 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TwistnbQ78WZ7 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TwistnbQ78WZ7 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TwistnbQ78WZ7 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TwistnbQ78WZ7 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TwistnbQ78WZ7 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TwistnbQ78WZ7 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
TwistnbQ78WZ7 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TwistnbQ78WZ7 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TwistnbQ78WZ7 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TwistnbQ78WZ7 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TwistnbQ78WZ7 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TwistnbQ78WZ7 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms