Protein–RNA interactions for Protein: Q768S4

Rph3al, Rab effector Noc2, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rph3alQ768S4 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rph3alQ768S4 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rph3alQ768S4 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rph3alQ768S4 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rph3alQ768S4 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rph3alQ768S4 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rph3alQ768S4 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rph3alQ768S4 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rph3alQ768S4 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rph3alQ768S4 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rph3alQ768S4 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rph3alQ768S4 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rph3alQ768S4 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rph3alQ768S4 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rph3alQ768S4 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rph3alQ768S4 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rph3alQ768S4 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rph3alQ768S4 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rph3alQ768S4 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rph3alQ768S4 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rph3alQ768S4 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rph3alQ768S4 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rph3alQ768S4 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rph3alQ768S4 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rph3alQ768S4 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rph3alQ768S4 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rph3alQ768S4 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rph3alQ768S4 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rph3alQ768S4 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rph3alQ768S4 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rph3alQ768S4 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rph3alQ768S4 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rph3alQ768S4 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rph3alQ768S4 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rph3alQ768S4 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Rph3alQ768S4 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rph3alQ768S4 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rph3alQ768S4 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rph3alQ768S4 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rph3alQ768S4 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rph3alQ768S4 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rph3alQ768S4 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rph3alQ768S4 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rph3alQ768S4 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rph3alQ768S4 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rph3alQ768S4 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rph3alQ768S4 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rph3alQ768S4 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rph3alQ768S4 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rph3alQ768S4 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rph3alQ768S4 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rph3alQ768S4 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rph3alQ768S4 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rph3alQ768S4 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rph3alQ768S4 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rph3alQ768S4 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rph3alQ768S4 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Rph3alQ768S4 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rph3alQ768S4 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rph3alQ768S4 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rph3alQ768S4 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rph3alQ768S4 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rph3alQ768S4 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rph3alQ768S4 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rph3alQ768S4 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rph3alQ768S4 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rph3alQ768S4 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rph3alQ768S4 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rph3alQ768S4 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rph3alQ768S4 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rph3alQ768S4 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rph3alQ768S4 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rph3alQ768S4 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rph3alQ768S4 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rph3alQ768S4 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rph3alQ768S4 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rph3alQ768S4 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rph3alQ768S4 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rph3alQ768S4 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rph3alQ768S4 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rph3alQ768S4 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rph3alQ768S4 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rph3alQ768S4 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rph3alQ768S4 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Rph3alQ768S4 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rph3alQ768S4 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rph3alQ768S4 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rph3alQ768S4 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rph3alQ768S4 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rph3alQ768S4 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rph3alQ768S4 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rph3alQ768S4 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rph3alQ768S4 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rph3alQ768S4 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rph3alQ768S4 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rph3alQ768S4 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rph3alQ768S4 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rph3alQ768S4 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rph3alQ768S4 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rph3alQ768S4 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
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