Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWZ2

Ube2r2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 R2, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2r2Q6ZWZ2 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ube2r2Q6ZWZ2 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ube2r2Q6ZWZ2 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ube2r2Q6ZWZ2 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ube2r2Q6ZWZ2 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ube2r2Q6ZWZ2 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ube2r2Q6ZWZ2 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ube2r2Q6ZWZ2 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ube2r2Q6ZWZ2 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ube2r2Q6ZWZ2 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ube2r2Q6ZWZ2 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ube2r2Q6ZWZ2 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ube2r2Q6ZWZ2 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ube2r2Q6ZWZ2 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ube2r2Q6ZWZ2 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ube2r2Q6ZWZ2 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ube2r2Q6ZWZ2 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ube2r2Q6ZWZ2 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ube2r2Q6ZWZ2 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ube2r2Q6ZWZ2 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ube2r2Q6ZWZ2 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ube2r2Q6ZWZ2 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ube2r2Q6ZWZ2 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ube2r2Q6ZWZ2 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ube2r2Q6ZWZ2 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ube2r2Q6ZWZ2 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ube2r2Q6ZWZ2 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ube2r2Q6ZWZ2 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ube2r2Q6ZWZ2 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ube2r2Q6ZWZ2 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ube2r2Q6ZWZ2 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ube2r2Q6ZWZ2 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ube2r2Q6ZWZ2 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ube2r2Q6ZWZ2 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ube2r2Q6ZWZ2 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ube2r2Q6ZWZ2 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ube2r2Q6ZWZ2 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ube2r2Q6ZWZ2 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ube2r2Q6ZWZ2 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ube2r2Q6ZWZ2 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ube2r2Q6ZWZ2 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ube2r2Q6ZWZ2 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ube2r2Q6ZWZ2 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ube2r2Q6ZWZ2 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ube2r2Q6ZWZ2 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ube2r2Q6ZWZ2 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ube2r2Q6ZWZ2 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ube2r2Q6ZWZ2 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ube2r2Q6ZWZ2 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ube2r2Q6ZWZ2 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ube2r2Q6ZWZ2 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ube2r2Q6ZWZ2 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ube2r2Q6ZWZ2 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ube2r2Q6ZWZ2 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ube2r2Q6ZWZ2 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ube2r2Q6ZWZ2 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ube2r2Q6ZWZ2 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ube2r2Q6ZWZ2 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ube2r2Q6ZWZ2 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ube2r2Q6ZWZ2 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ube2r2Q6ZWZ2 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ube2r2Q6ZWZ2 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ube2r2Q6ZWZ2 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ube2r2Q6ZWZ2 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ube2r2Q6ZWZ2 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ube2r2Q6ZWZ2 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ube2r2Q6ZWZ2 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ube2r2Q6ZWZ2 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ube2r2Q6ZWZ2 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ube2r2Q6ZWZ2 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ube2r2Q6ZWZ2 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ube2r2Q6ZWZ2 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ube2r2Q6ZWZ2 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ube2r2Q6ZWZ2 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ube2r2Q6ZWZ2 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ube2r2Q6ZWZ2 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ube2r2Q6ZWZ2 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ube2r2Q6ZWZ2 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ube2r2Q6ZWZ2 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ube2r2Q6ZWZ2 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ube2r2Q6ZWZ2 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ube2r2Q6ZWZ2 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ube2r2Q6ZWZ2 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ube2r2Q6ZWZ2 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ube2r2Q6ZWZ2 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ube2r2Q6ZWZ2 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ube2r2Q6ZWZ2 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ube2r2Q6ZWZ2 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ube2r2Q6ZWZ2 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ube2r2Q6ZWZ2 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ube2r2Q6ZWZ2 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms