Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQK0

Ncapd3, Condensin-2 complex subunit D3, mousemouse

Predictions only

Length 1,506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncapd3Q6ZQK0 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ncapd3Q6ZQK0 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ncapd3Q6ZQK0 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ncapd3Q6ZQK0 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ncapd3Q6ZQK0 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ncapd3Q6ZQK0 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ncapd3Q6ZQK0 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ncapd3Q6ZQK0 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ncapd3Q6ZQK0 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ncapd3Q6ZQK0 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Ncapd3Q6ZQK0 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ncapd3Q6ZQK0 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ncapd3Q6ZQK0 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ncapd3Q6ZQK0 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ncapd3Q6ZQK0 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ncapd3Q6ZQK0 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ncapd3Q6ZQK0 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ncapd3Q6ZQK0 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ncapd3Q6ZQK0 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Ncapd3Q6ZQK0 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ncapd3Q6ZQK0 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ncapd3Q6ZQK0 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Ncapd3Q6ZQK0 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ncapd3Q6ZQK0 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ncapd3Q6ZQK0 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ncapd3Q6ZQK0 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ncapd3Q6ZQK0 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ncapd3Q6ZQK0 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ncapd3Q6ZQK0 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ncapd3Q6ZQK0 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ncapd3Q6ZQK0 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Ncapd3Q6ZQK0 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Ncapd3Q6ZQK0 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ncapd3Q6ZQK0 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Ncapd3Q6ZQK0 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Ncapd3Q6ZQK0 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Ncapd3Q6ZQK0 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Ncapd3Q6ZQK0 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ncapd3Q6ZQK0 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ncapd3Q6ZQK0 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ncapd3Q6ZQK0 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ncapd3Q6ZQK0 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ncapd3Q6ZQK0 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ncapd3Q6ZQK0 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ncapd3Q6ZQK0 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ncapd3Q6ZQK0 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ncapd3Q6ZQK0 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ncapd3Q6ZQK0 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ncapd3Q6ZQK0 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Ncapd3Q6ZQK0 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ncapd3Q6ZQK0 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ncapd3Q6ZQK0 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ncapd3Q6ZQK0 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ncapd3Q6ZQK0 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Ncapd3Q6ZQK0 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ncapd3Q6ZQK0 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Ncapd3Q6ZQK0 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ncapd3Q6ZQK0 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ncapd3Q6ZQK0 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ncapd3Q6ZQK0 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ncapd3Q6ZQK0 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ncapd3Q6ZQK0 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ncapd3Q6ZQK0 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ncapd3Q6ZQK0 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ncapd3Q6ZQK0 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ncapd3Q6ZQK0 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ncapd3Q6ZQK0 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ncapd3Q6ZQK0 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ncapd3Q6ZQK0 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ncapd3Q6ZQK0 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ncapd3Q6ZQK0 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ncapd3Q6ZQK0 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ncapd3Q6ZQK0 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ncapd3Q6ZQK0 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ncapd3Q6ZQK0 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ncapd3Q6ZQK0 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ncapd3Q6ZQK0 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ncapd3Q6ZQK0 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ncapd3Q6ZQK0 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ncapd3Q6ZQK0 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ncapd3Q6ZQK0 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ncapd3Q6ZQK0 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ncapd3Q6ZQK0 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ncapd3Q6ZQK0 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ncapd3Q6ZQK0 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ncapd3Q6ZQK0 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ncapd3Q6ZQK0 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ncapd3Q6ZQK0 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ncapd3Q6ZQK0 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Ncapd3Q6ZQK0 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Ncapd3Q6ZQK0 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ncapd3Q6ZQK0 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ncapd3Q6ZQK0 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ncapd3Q6ZQK0 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ncapd3Q6ZQK0 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ncapd3Q6ZQK0 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ncapd3Q6ZQK0 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ncapd3Q6ZQK0 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ncapd3Q6ZQK0 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Ncapd3Q6ZQK0 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms