Protein–RNA interactions for Protein: Q6VH22

Ift172, Intraflagellar transport protein 172 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift172Q6VH22 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ift172Q6VH22 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ift172Q6VH22 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ift172Q6VH22 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ift172Q6VH22 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Ift172Q6VH22 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Ift172Q6VH22 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ift172Q6VH22 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ift172Q6VH22 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ift172Q6VH22 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ift172Q6VH22 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ift172Q6VH22 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ift172Q6VH22 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ift172Q6VH22 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ift172Q6VH22 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ift172Q6VH22 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ift172Q6VH22 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Ift172Q6VH22 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ift172Q6VH22 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ift172Q6VH22 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ift172Q6VH22 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ift172Q6VH22 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ift172Q6VH22 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ift172Q6VH22 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ift172Q6VH22 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Ift172Q6VH22 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ift172Q6VH22 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ift172Q6VH22 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ift172Q6VH22 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ift172Q6VH22 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ift172Q6VH22 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ift172Q6VH22 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Ift172Q6VH22 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ift172Q6VH22 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ift172Q6VH22 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Ift172Q6VH22 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ift172Q6VH22 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ift172Q6VH22 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ift172Q6VH22 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ift172Q6VH22 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ift172Q6VH22 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ift172Q6VH22 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ift172Q6VH22 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ift172Q6VH22 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ift172Q6VH22 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ift172Q6VH22 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ift172Q6VH22 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ift172Q6VH22 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ift172Q6VH22 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ift172Q6VH22 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ift172Q6VH22 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ift172Q6VH22 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ift172Q6VH22 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ift172Q6VH22 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ift172Q6VH22 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ift172Q6VH22 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ift172Q6VH22 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ift172Q6VH22 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ift172Q6VH22 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ift172Q6VH22 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ift172Q6VH22 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ift172Q6VH22 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ift172Q6VH22 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ift172Q6VH22 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ift172Q6VH22 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ift172Q6VH22 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ift172Q6VH22 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ift172Q6VH22 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ift172Q6VH22 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ift172Q6VH22 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ift172Q6VH22 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ift172Q6VH22 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ift172Q6VH22 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ift172Q6VH22 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ift172Q6VH22 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ift172Q6VH22 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ift172Q6VH22 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ift172Q6VH22 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ift172Q6VH22 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ift172Q6VH22 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ift172Q6VH22 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ift172Q6VH22 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ift172Q6VH22 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ift172Q6VH22 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ift172Q6VH22 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ift172Q6VH22 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ift172Q6VH22 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ift172Q6VH22 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Ift172Q6VH22 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Ift172Q6VH22 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ift172Q6VH22 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ift172Q6VH22 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ift172Q6VH22 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ift172Q6VH22 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ift172Q6VH22 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ift172Q6VH22 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ift172Q6VH22 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ift172Q6VH22 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ift172Q6VH22 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ift172Q6VH22 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms