Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc88cQ6VGS5 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc88cQ6VGS5 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc88cQ6VGS5 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc88cQ6VGS5 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc88cQ6VGS5 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc88cQ6VGS5 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc88cQ6VGS5 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc88cQ6VGS5 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc88cQ6VGS5 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc88cQ6VGS5 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc88cQ6VGS5 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc88cQ6VGS5 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc88cQ6VGS5 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc88cQ6VGS5 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc88cQ6VGS5 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc88cQ6VGS5 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc88cQ6VGS5 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc88cQ6VGS5 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc88cQ6VGS5 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ccdc88cQ6VGS5 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ccdc88cQ6VGS5 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc88cQ6VGS5 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc88cQ6VGS5 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc88cQ6VGS5 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc88cQ6VGS5 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc88cQ6VGS5 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc88cQ6VGS5 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc88cQ6VGS5 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc88cQ6VGS5 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc88cQ6VGS5 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc88cQ6VGS5 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc88cQ6VGS5 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc88cQ6VGS5 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc88cQ6VGS5 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc88cQ6VGS5 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc88cQ6VGS5 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc88cQ6VGS5 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc88cQ6VGS5 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc88cQ6VGS5 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc88cQ6VGS5 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc88cQ6VGS5 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc88cQ6VGS5 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc88cQ6VGS5 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc88cQ6VGS5 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc88cQ6VGS5 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc88cQ6VGS5 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc88cQ6VGS5 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc88cQ6VGS5 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc88cQ6VGS5 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc88cQ6VGS5 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc88cQ6VGS5 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc88cQ6VGS5 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc88cQ6VGS5 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc88cQ6VGS5 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc88cQ6VGS5 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc88cQ6VGS5 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc88cQ6VGS5 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc88cQ6VGS5 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc88cQ6VGS5 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc88cQ6VGS5 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc88cQ6VGS5 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc88cQ6VGS5 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc88cQ6VGS5 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc88cQ6VGS5 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc88cQ6VGS5 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc88cQ6VGS5 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc88cQ6VGS5 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc88cQ6VGS5 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc88cQ6VGS5 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc88cQ6VGS5 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc88cQ6VGS5 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc88cQ6VGS5 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc88cQ6VGS5 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc88cQ6VGS5 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc88cQ6VGS5 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc88cQ6VGS5 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc88cQ6VGS5 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc88cQ6VGS5 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc88cQ6VGS5 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc88cQ6VGS5 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc88cQ6VGS5 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc88cQ6VGS5 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc88cQ6VGS5 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc88cQ6VGS5 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc88cQ6VGS5 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc88cQ6VGS5 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc88cQ6VGS5 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc88cQ6VGS5 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc88cQ6VGS5 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc88cQ6VGS5 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc88cQ6VGS5 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc88cQ6VGS5 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc88cQ6VGS5 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc88cQ6VGS5 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc88cQ6VGS5 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc88cQ6VGS5 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc88cQ6VGS5 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms