Protein–RNA interactions for Protein: Q6S5L9

Shc4, SHC-transforming protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shc4Q6S5L9 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Shc4Q6S5L9 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Shc4Q6S5L9 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Shc4Q6S5L9 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Shc4Q6S5L9 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Shc4Q6S5L9 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Shc4Q6S5L9 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shc4Q6S5L9 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shc4Q6S5L9 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shc4Q6S5L9 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shc4Q6S5L9 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shc4Q6S5L9 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shc4Q6S5L9 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shc4Q6S5L9 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shc4Q6S5L9 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shc4Q6S5L9 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shc4Q6S5L9 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shc4Q6S5L9 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shc4Q6S5L9 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shc4Q6S5L9 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shc4Q6S5L9 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shc4Q6S5L9 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shc4Q6S5L9 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shc4Q6S5L9 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shc4Q6S5L9 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shc4Q6S5L9 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shc4Q6S5L9 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shc4Q6S5L9 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shc4Q6S5L9 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shc4Q6S5L9 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shc4Q6S5L9 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shc4Q6S5L9 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shc4Q6S5L9 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shc4Q6S5L9 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shc4Q6S5L9 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shc4Q6S5L9 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shc4Q6S5L9 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shc4Q6S5L9 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shc4Q6S5L9 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Shc4Q6S5L9 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Shc4Q6S5L9 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Shc4Q6S5L9 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Shc4Q6S5L9 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Shc4Q6S5L9 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Shc4Q6S5L9 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Shc4Q6S5L9 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Shc4Q6S5L9 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Shc4Q6S5L9 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Shc4Q6S5L9 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Shc4Q6S5L9 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Shc4Q6S5L9 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Shc4Q6S5L9 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Shc4Q6S5L9 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Shc4Q6S5L9 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Shc4Q6S5L9 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Shc4Q6S5L9 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Shc4Q6S5L9 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Shc4Q6S5L9 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Shc4Q6S5L9 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Shc4Q6S5L9 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Shc4Q6S5L9 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Shc4Q6S5L9 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Shc4Q6S5L9 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Shc4Q6S5L9 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Shc4Q6S5L9 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Shc4Q6S5L9 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Shc4Q6S5L9 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Shc4Q6S5L9 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Shc4Q6S5L9 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Shc4Q6S5L9 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Shc4Q6S5L9 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Shc4Q6S5L9 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Shc4Q6S5L9 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Shc4Q6S5L9 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Shc4Q6S5L9 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Shc4Q6S5L9 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Shc4Q6S5L9 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Shc4Q6S5L9 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Shc4Q6S5L9 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Shc4Q6S5L9 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Shc4Q6S5L9 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Shc4Q6S5L9 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Shc4Q6S5L9 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Shc4Q6S5L9 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Shc4Q6S5L9 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Shc4Q6S5L9 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Shc4Q6S5L9 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Shc4Q6S5L9 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Shc4Q6S5L9 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Shc4Q6S5L9 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Shc4Q6S5L9 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Shc4Q6S5L9 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Shc4Q6S5L9 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Shc4Q6S5L9 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Shc4Q6S5L9 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Shc4Q6S5L9 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Shc4Q6S5L9 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Shc4Q6S5L9 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Shc4Q6S5L9 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Shc4Q6S5L9 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms