Protein–RNA interactions for Protein: Q6RUU0

Ptx4, Pentraxin-4, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptx4Q6RUU0 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ptx4Q6RUU0 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ptx4Q6RUU0 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ptx4Q6RUU0 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ptx4Q6RUU0 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ptx4Q6RUU0 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ptx4Q6RUU0 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ptx4Q6RUU0 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ptx4Q6RUU0 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ptx4Q6RUU0 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ptx4Q6RUU0 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ptx4Q6RUU0 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ptx4Q6RUU0 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ptx4Q6RUU0 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ptx4Q6RUU0 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ptx4Q6RUU0 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ptx4Q6RUU0 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ptx4Q6RUU0 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ptx4Q6RUU0 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ptx4Q6RUU0 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ptx4Q6RUU0 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ptx4Q6RUU0 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ptx4Q6RUU0 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ptx4Q6RUU0 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ptx4Q6RUU0 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ptx4Q6RUU0 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ptx4Q6RUU0 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ptx4Q6RUU0 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ptx4Q6RUU0 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ptx4Q6RUU0 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ptx4Q6RUU0 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ptx4Q6RUU0 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ptx4Q6RUU0 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ptx4Q6RUU0 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ptx4Q6RUU0 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ptx4Q6RUU0 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ptx4Q6RUU0 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ptx4Q6RUU0 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ptx4Q6RUU0 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ptx4Q6RUU0 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ptx4Q6RUU0 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ptx4Q6RUU0 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ptx4Q6RUU0 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ptx4Q6RUU0 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ptx4Q6RUU0 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ptx4Q6RUU0 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ptx4Q6RUU0 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ptx4Q6RUU0 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ptx4Q6RUU0 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ptx4Q6RUU0 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ptx4Q6RUU0 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ptx4Q6RUU0 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ptx4Q6RUU0 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ptx4Q6RUU0 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ptx4Q6RUU0 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ptx4Q6RUU0 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ptx4Q6RUU0 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ptx4Q6RUU0 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ptx4Q6RUU0 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ptx4Q6RUU0 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ptx4Q6RUU0 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ptx4Q6RUU0 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ptx4Q6RUU0 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ptx4Q6RUU0 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ptx4Q6RUU0 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ptx4Q6RUU0 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ptx4Q6RUU0 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ptx4Q6RUU0 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ptx4Q6RUU0 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ptx4Q6RUU0 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ptx4Q6RUU0 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ptx4Q6RUU0 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ptx4Q6RUU0 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ptx4Q6RUU0 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ptx4Q6RUU0 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ptx4Q6RUU0 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ptx4Q6RUU0 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ptx4Q6RUU0 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ptx4Q6RUU0 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ptx4Q6RUU0 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ptx4Q6RUU0 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ptx4Q6RUU0 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ptx4Q6RUU0 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ptx4Q6RUU0 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ptx4Q6RUU0 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ptx4Q6RUU0 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ptx4Q6RUU0 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ptx4Q6RUU0 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ptx4Q6RUU0 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ptx4Q6RUU0 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ptx4Q6RUU0 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ptx4Q6RUU0 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ptx4Q6RUU0 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ptx4Q6RUU0 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ptx4Q6RUU0 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ptx4Q6RUU0 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ptx4Q6RUU0 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ptx4Q6RUU0 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ptx4Q6RUU0 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ptx4Q6RUU0 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.2 ms