Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDE8

Mfsd13a, Transmembrane protein 180, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfsd13aQ6PDE8 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mfsd13aQ6PDE8 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mfsd13aQ6PDE8 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mfsd13aQ6PDE8 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mfsd13aQ6PDE8 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mfsd13aQ6PDE8 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mfsd13aQ6PDE8 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mfsd13aQ6PDE8 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Mfsd13aQ6PDE8 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mfsd13aQ6PDE8 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mfsd13aQ6PDE8 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Mfsd13aQ6PDE8 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mfsd13aQ6PDE8 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mfsd13aQ6PDE8 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mfsd13aQ6PDE8 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mfsd13aQ6PDE8 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mfsd13aQ6PDE8 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mfsd13aQ6PDE8 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mfsd13aQ6PDE8 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mfsd13aQ6PDE8 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mfsd13aQ6PDE8 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mfsd13aQ6PDE8 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mfsd13aQ6PDE8 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mfsd13aQ6PDE8 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mfsd13aQ6PDE8 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mfsd13aQ6PDE8 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mfsd13aQ6PDE8 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mfsd13aQ6PDE8 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mfsd13aQ6PDE8 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mfsd13aQ6PDE8 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mfsd13aQ6PDE8 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mfsd13aQ6PDE8 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mfsd13aQ6PDE8 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mfsd13aQ6PDE8 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mfsd13aQ6PDE8 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mfsd13aQ6PDE8 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mfsd13aQ6PDE8 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mfsd13aQ6PDE8 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Mfsd13aQ6PDE8 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mfsd13aQ6PDE8 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mfsd13aQ6PDE8 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mfsd13aQ6PDE8 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mfsd13aQ6PDE8 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mfsd13aQ6PDE8 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mfsd13aQ6PDE8 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mfsd13aQ6PDE8 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mfsd13aQ6PDE8 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mfsd13aQ6PDE8 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Mfsd13aQ6PDE8 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Mfsd13aQ6PDE8 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Mfsd13aQ6PDE8 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Mfsd13aQ6PDE8 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mfsd13aQ6PDE8 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mfsd13aQ6PDE8 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mfsd13aQ6PDE8 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mfsd13aQ6PDE8 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Mfsd13aQ6PDE8 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mfsd13aQ6PDE8 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mfsd13aQ6PDE8 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mfsd13aQ6PDE8 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mfsd13aQ6PDE8 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mfsd13aQ6PDE8 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mfsd13aQ6PDE8 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mfsd13aQ6PDE8 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mfsd13aQ6PDE8 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mfsd13aQ6PDE8 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mfsd13aQ6PDE8 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mfsd13aQ6PDE8 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mfsd13aQ6PDE8 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mfsd13aQ6PDE8 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mfsd13aQ6PDE8 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mfsd13aQ6PDE8 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mfsd13aQ6PDE8 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mfsd13aQ6PDE8 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mfsd13aQ6PDE8 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mfsd13aQ6PDE8 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mfsd13aQ6PDE8 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mfsd13aQ6PDE8 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mfsd13aQ6PDE8 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mfsd13aQ6PDE8 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mfsd13aQ6PDE8 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mfsd13aQ6PDE8 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mfsd13aQ6PDE8 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mfsd13aQ6PDE8 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mfsd13aQ6PDE8 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mfsd13aQ6PDE8 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mfsd13aQ6PDE8 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mfsd13aQ6PDE8 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mfsd13aQ6PDE8 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mfsd13aQ6PDE8 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mfsd13aQ6PDE8 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mfsd13aQ6PDE8 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mfsd13aQ6PDE8 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mfsd13aQ6PDE8 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mfsd13aQ6PDE8 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mfsd13aQ6PDE8 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mfsd13aQ6PDE8 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Mfsd13aQ6PDE8 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mfsd13aQ6PDE8 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mfsd13aQ6PDE8 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.8 ms