Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD31

Trak1, Trafficking kinesin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 939 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trak1Q6PD31 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trak1Q6PD31 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trak1Q6PD31 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trak1Q6PD31 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trak1Q6PD31 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trak1Q6PD31 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trak1Q6PD31 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trak1Q6PD31 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trak1Q6PD31 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trak1Q6PD31 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trak1Q6PD31 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trak1Q6PD31 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Trak1Q6PD31 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trak1Q6PD31 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trak1Q6PD31 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trak1Q6PD31 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trak1Q6PD31 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trak1Q6PD31 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trak1Q6PD31 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trak1Q6PD31 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trak1Q6PD31 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trak1Q6PD31 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trak1Q6PD31 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trak1Q6PD31 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trak1Q6PD31 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trak1Q6PD31 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trak1Q6PD31 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Trak1Q6PD31 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trak1Q6PD31 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trak1Q6PD31 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trak1Q6PD31 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trak1Q6PD31 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trak1Q6PD31 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trak1Q6PD31 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trak1Q6PD31 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trak1Q6PD31 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trak1Q6PD31 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trak1Q6PD31 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Trak1Q6PD31 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trak1Q6PD31 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Trak1Q6PD31 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Trak1Q6PD31 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trak1Q6PD31 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trak1Q6PD31 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trak1Q6PD31 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trak1Q6PD31 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trak1Q6PD31 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trak1Q6PD31 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trak1Q6PD31 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trak1Q6PD31 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trak1Q6PD31 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trak1Q6PD31 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trak1Q6PD31 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trak1Q6PD31 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trak1Q6PD31 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trak1Q6PD31 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trak1Q6PD31 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trak1Q6PD31 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trak1Q6PD31 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trak1Q6PD31 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trak1Q6PD31 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trak1Q6PD31 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trak1Q6PD31 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trak1Q6PD31 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trak1Q6PD31 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trak1Q6PD31 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trak1Q6PD31 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trak1Q6PD31 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Trak1Q6PD31 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trak1Q6PD31 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trak1Q6PD31 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trak1Q6PD31 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trak1Q6PD31 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trak1Q6PD31 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trak1Q6PD31 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trak1Q6PD31 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trak1Q6PD31 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trak1Q6PD31 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trak1Q6PD31 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trak1Q6PD31 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trak1Q6PD31 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trak1Q6PD31 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trak1Q6PD31 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trak1Q6PD31 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trak1Q6PD31 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Trak1Q6PD31 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Trak1Q6PD31 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Trak1Q6PD31 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Trak1Q6PD31 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
Trak1Q6PD31 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Trak1Q6PD31 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trak1Q6PD31 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trak1Q6PD31 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trak1Q6PD31 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trak1Q6PD31 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Trak1Q6PD31 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Trak1Q6PD31 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trak1Q6PD31 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trak1Q6PD31 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Trak1Q6PD31 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 198.7 ms