Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAR5

Gapvd1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gapvd1Q6PAR5 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gapvd1Q6PAR5 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gapvd1Q6PAR5 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gapvd1Q6PAR5 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gapvd1Q6PAR5 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gapvd1Q6PAR5 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gapvd1Q6PAR5 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gapvd1Q6PAR5 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gapvd1Q6PAR5 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gapvd1Q6PAR5 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gapvd1Q6PAR5 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gapvd1Q6PAR5 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gapvd1Q6PAR5 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Gapvd1Q6PAR5 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gapvd1Q6PAR5 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Gapvd1Q6PAR5 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gapvd1Q6PAR5 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gapvd1Q6PAR5 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gapvd1Q6PAR5 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Gapvd1Q6PAR5 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Gapvd1Q6PAR5 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gapvd1Q6PAR5 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gapvd1Q6PAR5 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gapvd1Q6PAR5 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Gapvd1Q6PAR5 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Gapvd1Q6PAR5 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Gapvd1Q6PAR5 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gapvd1Q6PAR5 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gapvd1Q6PAR5 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gapvd1Q6PAR5 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gapvd1Q6PAR5 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Gapvd1Q6PAR5 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gapvd1Q6PAR5 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gapvd1Q6PAR5 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gapvd1Q6PAR5 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gapvd1Q6PAR5 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gapvd1Q6PAR5 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gapvd1Q6PAR5 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gapvd1Q6PAR5 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gapvd1Q6PAR5 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gapvd1Q6PAR5 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Gapvd1Q6PAR5 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gapvd1Q6PAR5 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gapvd1Q6PAR5 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gapvd1Q6PAR5 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gapvd1Q6PAR5 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gapvd1Q6PAR5 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Gapvd1Q6PAR5 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gapvd1Q6PAR5 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gapvd1Q6PAR5 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gapvd1Q6PAR5 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gapvd1Q6PAR5 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gapvd1Q6PAR5 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gapvd1Q6PAR5 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gapvd1Q6PAR5 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gapvd1Q6PAR5 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gapvd1Q6PAR5 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Gapvd1Q6PAR5 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Gapvd1Q6PAR5 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gapvd1Q6PAR5 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gapvd1Q6PAR5 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gapvd1Q6PAR5 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Gapvd1Q6PAR5 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gapvd1Q6PAR5 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gapvd1Q6PAR5 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Gapvd1Q6PAR5 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gapvd1Q6PAR5 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Gapvd1Q6PAR5 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gapvd1Q6PAR5 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gapvd1Q6PAR5 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gapvd1Q6PAR5 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gapvd1Q6PAR5 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gapvd1Q6PAR5 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Gapvd1Q6PAR5 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gapvd1Q6PAR5 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gapvd1Q6PAR5 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gapvd1Q6PAR5 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gapvd1Q6PAR5 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gapvd1Q6PAR5 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Gapvd1Q6PAR5 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Gapvd1Q6PAR5 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Gapvd1Q6PAR5 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Gapvd1Q6PAR5 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Gapvd1Q6PAR5 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gapvd1Q6PAR5 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Gapvd1Q6PAR5 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gapvd1Q6PAR5 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gapvd1Q6PAR5 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gapvd1Q6PAR5 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gapvd1Q6PAR5 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gapvd1Q6PAR5 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gapvd1Q6PAR5 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gapvd1Q6PAR5 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gapvd1Q6PAR5 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gapvd1Q6PAR5 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gapvd1Q6PAR5 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gapvd1Q6PAR5 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gapvd1Q6PAR5 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gapvd1Q6PAR5 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gapvd1Q6PAR5 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82 ms