Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8I2

BC061237, MCG114023, isoform CRA_b, mousemouse

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Length 184 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC061237Q6P8I2 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BC061237Q6P8I2 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BC061237Q6P8I2 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BC061237Q6P8I2 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BC061237Q6P8I2 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BC061237Q6P8I2 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BC061237Q6P8I2 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BC061237Q6P8I2 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
BC061237Q6P8I2 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BC061237Q6P8I2 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
BC061237Q6P8I2 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BC061237Q6P8I2 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BC061237Q6P8I2 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BC061237Q6P8I2 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BC061237Q6P8I2 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BC061237Q6P8I2 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BC061237Q6P8I2 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BC061237Q6P8I2 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BC061237Q6P8I2 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BC061237Q6P8I2 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BC061237Q6P8I2 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BC061237Q6P8I2 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BC061237Q6P8I2 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BC061237Q6P8I2 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BC061237Q6P8I2 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BC061237Q6P8I2 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BC061237Q6P8I2 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BC061237Q6P8I2 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BC061237Q6P8I2 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BC061237Q6P8I2 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BC061237Q6P8I2 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BC061237Q6P8I2 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BC061237Q6P8I2 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
BC061237Q6P8I2 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BC061237Q6P8I2 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BC061237Q6P8I2 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BC061237Q6P8I2 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BC061237Q6P8I2 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BC061237Q6P8I2 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BC061237Q6P8I2 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BC061237Q6P8I2 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BC061237Q6P8I2 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BC061237Q6P8I2 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BC061237Q6P8I2 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BC061237Q6P8I2 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BC061237Q6P8I2 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BC061237Q6P8I2 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BC061237Q6P8I2 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BC061237Q6P8I2 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BC061237Q6P8I2 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BC061237Q6P8I2 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BC061237Q6P8I2 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BC061237Q6P8I2 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BC061237Q6P8I2 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BC061237Q6P8I2 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BC061237Q6P8I2 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BC061237Q6P8I2 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BC061237Q6P8I2 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BC061237Q6P8I2 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BC061237Q6P8I2 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BC061237Q6P8I2 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BC061237Q6P8I2 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BC061237Q6P8I2 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BC061237Q6P8I2 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BC061237Q6P8I2 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
BC061237Q6P8I2 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BC061237Q6P8I2 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BC061237Q6P8I2 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BC061237Q6P8I2 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BC061237Q6P8I2 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BC061237Q6P8I2 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
BC061237Q6P8I2 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BC061237Q6P8I2 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BC061237Q6P8I2 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BC061237Q6P8I2 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BC061237Q6P8I2 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BC061237Q6P8I2 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BC061237Q6P8I2 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BC061237Q6P8I2 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BC061237Q6P8I2 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BC061237Q6P8I2 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BC061237Q6P8I2 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BC061237Q6P8I2 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BC061237Q6P8I2 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BC061237Q6P8I2 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BC061237Q6P8I2 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BC061237Q6P8I2 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BC061237Q6P8I2 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BC061237Q6P8I2 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BC061237Q6P8I2 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BC061237Q6P8I2 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BC061237Q6P8I2 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BC061237Q6P8I2 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BC061237Q6P8I2 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BC061237Q6P8I2 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BC061237Q6P8I2 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
BC061237Q6P8I2 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BC061237Q6P8I2 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BC061237Q6P8I2 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BC061237Q6P8I2 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.5 ms