Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4T0

Atg2a, Autophagy-related protein 2 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 1,914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg2aQ6P4T0 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atg2aQ6P4T0 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atg2aQ6P4T0 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atg2aQ6P4T0 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atg2aQ6P4T0 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atg2aQ6P4T0 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atg2aQ6P4T0 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atg2aQ6P4T0 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atg2aQ6P4T0 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atg2aQ6P4T0 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atg2aQ6P4T0 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atg2aQ6P4T0 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atg2aQ6P4T0 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atg2aQ6P4T0 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atg2aQ6P4T0 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atg2aQ6P4T0 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atg2aQ6P4T0 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Atg2aQ6P4T0 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atg2aQ6P4T0 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atg2aQ6P4T0 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atg2aQ6P4T0 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atg2aQ6P4T0 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atg2aQ6P4T0 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atg2aQ6P4T0 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atg2aQ6P4T0 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atg2aQ6P4T0 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atg2aQ6P4T0 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atg2aQ6P4T0 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Atg2aQ6P4T0 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atg2aQ6P4T0 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Atg2aQ6P4T0 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atg2aQ6P4T0 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atg2aQ6P4T0 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atg2aQ6P4T0 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atg2aQ6P4T0 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atg2aQ6P4T0 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atg2aQ6P4T0 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atg2aQ6P4T0 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atg2aQ6P4T0 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atg2aQ6P4T0 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atg2aQ6P4T0 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atg2aQ6P4T0 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atg2aQ6P4T0 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atg2aQ6P4T0 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atg2aQ6P4T0 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atg2aQ6P4T0 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atg2aQ6P4T0 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atg2aQ6P4T0 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atg2aQ6P4T0 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atg2aQ6P4T0 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atg2aQ6P4T0 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atg2aQ6P4T0 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atg2aQ6P4T0 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atg2aQ6P4T0 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atg2aQ6P4T0 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atg2aQ6P4T0 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Atg2aQ6P4T0 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atg2aQ6P4T0 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atg2aQ6P4T0 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Atg2aQ6P4T0 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atg2aQ6P4T0 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atg2aQ6P4T0 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atg2aQ6P4T0 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atg2aQ6P4T0 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Atg2aQ6P4T0 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atg2aQ6P4T0 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atg2aQ6P4T0 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atg2aQ6P4T0 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atg2aQ6P4T0 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atg2aQ6P4T0 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atg2aQ6P4T0 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atg2aQ6P4T0 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atg2aQ6P4T0 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atg2aQ6P4T0 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atg2aQ6P4T0 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atg2aQ6P4T0 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atg2aQ6P4T0 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atg2aQ6P4T0 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atg2aQ6P4T0 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Atg2aQ6P4T0 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atg2aQ6P4T0 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atg2aQ6P4T0 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atg2aQ6P4T0 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atg2aQ6P4T0 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atg2aQ6P4T0 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atg2aQ6P4T0 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atg2aQ6P4T0 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atg2aQ6P4T0 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atg2aQ6P4T0 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atg2aQ6P4T0 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Atg2aQ6P4T0 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atg2aQ6P4T0 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atg2aQ6P4T0 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atg2aQ6P4T0 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atg2aQ6P4T0 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atg2aQ6P4T0 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atg2aQ6P4T0 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atg2aQ6P4T0 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atg2aQ6P4T0 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atg2aQ6P4T0 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms