Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1E1

Zmiz1, Zinc finger MIZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,072 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zmiz1Q6P1E1 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zmiz1Q6P1E1 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zmiz1Q6P1E1 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zmiz1Q6P1E1 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zmiz1Q6P1E1 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zmiz1Q6P1E1 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zmiz1Q6P1E1 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zmiz1Q6P1E1 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zmiz1Q6P1E1 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zmiz1Q6P1E1 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zmiz1Q6P1E1 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zmiz1Q6P1E1 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zmiz1Q6P1E1 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zmiz1Q6P1E1 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zmiz1Q6P1E1 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zmiz1Q6P1E1 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zmiz1Q6P1E1 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zmiz1Q6P1E1 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zmiz1Q6P1E1 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Zmiz1Q6P1E1 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Zmiz1Q6P1E1 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Zmiz1Q6P1E1 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Zmiz1Q6P1E1 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Zmiz1Q6P1E1 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Zmiz1Q6P1E1 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Zmiz1Q6P1E1 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zmiz1Q6P1E1 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zmiz1Q6P1E1 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zmiz1Q6P1E1 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zmiz1Q6P1E1 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zmiz1Q6P1E1 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zmiz1Q6P1E1 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zmiz1Q6P1E1 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zmiz1Q6P1E1 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zmiz1Q6P1E1 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zmiz1Q6P1E1 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zmiz1Q6P1E1 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zmiz1Q6P1E1 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zmiz1Q6P1E1 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zmiz1Q6P1E1 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zmiz1Q6P1E1 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zmiz1Q6P1E1 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zmiz1Q6P1E1 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zmiz1Q6P1E1 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zmiz1Q6P1E1 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zmiz1Q6P1E1 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zmiz1Q6P1E1 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zmiz1Q6P1E1 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zmiz1Q6P1E1 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zmiz1Q6P1E1 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zmiz1Q6P1E1 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Zmiz1Q6P1E1 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Zmiz1Q6P1E1 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Zmiz1Q6P1E1 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zmiz1Q6P1E1 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zmiz1Q6P1E1 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zmiz1Q6P1E1 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zmiz1Q6P1E1 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zmiz1Q6P1E1 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zmiz1Q6P1E1 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zmiz1Q6P1E1 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Zmiz1Q6P1E1 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zmiz1Q6P1E1 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zmiz1Q6P1E1 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zmiz1Q6P1E1 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zmiz1Q6P1E1 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zmiz1Q6P1E1 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Zmiz1Q6P1E1 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zmiz1Q6P1E1 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zmiz1Q6P1E1 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zmiz1Q6P1E1 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zmiz1Q6P1E1 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zmiz1Q6P1E1 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zmiz1Q6P1E1 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zmiz1Q6P1E1 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zmiz1Q6P1E1 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zmiz1Q6P1E1 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zmiz1Q6P1E1 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zmiz1Q6P1E1 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zmiz1Q6P1E1 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zmiz1Q6P1E1 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zmiz1Q6P1E1 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Zmiz1Q6P1E1 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zmiz1Q6P1E1 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zmiz1Q6P1E1 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zmiz1Q6P1E1 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zmiz1Q6P1E1 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zmiz1Q6P1E1 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zmiz1Q6P1E1 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zmiz1Q6P1E1 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zmiz1Q6P1E1 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zmiz1Q6P1E1 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zmiz1Q6P1E1 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zmiz1Q6P1E1 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zmiz1Q6P1E1 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zmiz1Q6P1E1 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zmiz1Q6P1E1 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zmiz1Q6P1E1 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zmiz1Q6P1E1 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Zmiz1Q6P1E1 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms