Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZL0

Soga3, Protein SOGA3, mousemouse

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Length 945 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Soga3Q6NZL0 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Soga3Q6NZL0 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Soga3Q6NZL0 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Soga3Q6NZL0 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Soga3Q6NZL0 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Soga3Q6NZL0 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Soga3Q6NZL0 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Soga3Q6NZL0 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Soga3Q6NZL0 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Soga3Q6NZL0 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Soga3Q6NZL0 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Soga3Q6NZL0 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Soga3Q6NZL0 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Soga3Q6NZL0 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Soga3Q6NZL0 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Soga3Q6NZL0 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Soga3Q6NZL0 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Soga3Q6NZL0 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Soga3Q6NZL0 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Soga3Q6NZL0 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Soga3Q6NZL0 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Soga3Q6NZL0 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Soga3Q6NZL0 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Soga3Q6NZL0 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Soga3Q6NZL0 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Soga3Q6NZL0 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Soga3Q6NZL0 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Soga3Q6NZL0 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Soga3Q6NZL0 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Soga3Q6NZL0 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Soga3Q6NZL0 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Soga3Q6NZL0 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Soga3Q6NZL0 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Soga3Q6NZL0 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Soga3Q6NZL0 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Soga3Q6NZL0 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Soga3Q6NZL0 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Soga3Q6NZL0 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Soga3Q6NZL0 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Soga3Q6NZL0 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Soga3Q6NZL0 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Soga3Q6NZL0 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Soga3Q6NZL0 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Soga3Q6NZL0 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Soga3Q6NZL0 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Soga3Q6NZL0 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Soga3Q6NZL0 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Soga3Q6NZL0 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Soga3Q6NZL0 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Soga3Q6NZL0 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Soga3Q6NZL0 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Soga3Q6NZL0 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Soga3Q6NZL0 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Soga3Q6NZL0 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Soga3Q6NZL0 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Soga3Q6NZL0 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Soga3Q6NZL0 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Soga3Q6NZL0 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Soga3Q6NZL0 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Soga3Q6NZL0 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Soga3Q6NZL0 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Soga3Q6NZL0 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Soga3Q6NZL0 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Soga3Q6NZL0 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Soga3Q6NZL0 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Soga3Q6NZL0 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Soga3Q6NZL0 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Soga3Q6NZL0 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Soga3Q6NZL0 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Soga3Q6NZL0 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Soga3Q6NZL0 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Soga3Q6NZL0 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Soga3Q6NZL0 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Soga3Q6NZL0 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Soga3Q6NZL0 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Soga3Q6NZL0 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Soga3Q6NZL0 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Soga3Q6NZL0 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Soga3Q6NZL0 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Soga3Q6NZL0 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Soga3Q6NZL0 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Soga3Q6NZL0 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Soga3Q6NZL0 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Soga3Q6NZL0 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Soga3Q6NZL0 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Soga3Q6NZL0 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Soga3Q6NZL0 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Soga3Q6NZL0 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Soga3Q6NZL0 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Soga3Q6NZL0 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Soga3Q6NZL0 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Soga3Q6NZL0 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Soga3Q6NZL0 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Soga3Q6NZL0 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Soga3Q6NZL0 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Soga3Q6NZL0 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Soga3Q6NZL0 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Soga3Q6NZL0 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Soga3Q6NZL0 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Soga3Q6NZL0 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms