Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXN1

Szrd1, SUZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Szrd1Q6NXN1 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Szrd1Q6NXN1 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Szrd1Q6NXN1 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Szrd1Q6NXN1 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Szrd1Q6NXN1 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Szrd1Q6NXN1 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Szrd1Q6NXN1 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Szrd1Q6NXN1 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Szrd1Q6NXN1 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Szrd1Q6NXN1 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Szrd1Q6NXN1 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Szrd1Q6NXN1 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Szrd1Q6NXN1 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Szrd1Q6NXN1 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Szrd1Q6NXN1 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Szrd1Q6NXN1 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Szrd1Q6NXN1 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Szrd1Q6NXN1 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Szrd1Q6NXN1 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Szrd1Q6NXN1 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Szrd1Q6NXN1 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Szrd1Q6NXN1 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Szrd1Q6NXN1 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Szrd1Q6NXN1 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Szrd1Q6NXN1 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Szrd1Q6NXN1 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Szrd1Q6NXN1 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Szrd1Q6NXN1 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Szrd1Q6NXN1 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Szrd1Q6NXN1 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Szrd1Q6NXN1 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Szrd1Q6NXN1 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Szrd1Q6NXN1 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Szrd1Q6NXN1 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Szrd1Q6NXN1 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Szrd1Q6NXN1 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Szrd1Q6NXN1 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Szrd1Q6NXN1 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Szrd1Q6NXN1 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Szrd1Q6NXN1 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Szrd1Q6NXN1 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Szrd1Q6NXN1 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Szrd1Q6NXN1 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Szrd1Q6NXN1 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Szrd1Q6NXN1 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Szrd1Q6NXN1 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Szrd1Q6NXN1 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Szrd1Q6NXN1 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Szrd1Q6NXN1 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Szrd1Q6NXN1 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Szrd1Q6NXN1 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Szrd1Q6NXN1 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Szrd1Q6NXN1 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Szrd1Q6NXN1 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Szrd1Q6NXN1 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Szrd1Q6NXN1 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Szrd1Q6NXN1 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Szrd1Q6NXN1 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Szrd1Q6NXN1 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Szrd1Q6NXN1 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Szrd1Q6NXN1 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Szrd1Q6NXN1 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Szrd1Q6NXN1 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Szrd1Q6NXN1 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Szrd1Q6NXN1 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Szrd1Q6NXN1 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Szrd1Q6NXN1 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Szrd1Q6NXN1 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Szrd1Q6NXN1 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Szrd1Q6NXN1 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Szrd1Q6NXN1 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Szrd1Q6NXN1 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Szrd1Q6NXN1 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Szrd1Q6NXN1 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Szrd1Q6NXN1 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Szrd1Q6NXN1 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Szrd1Q6NXN1 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Szrd1Q6NXN1 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Szrd1Q6NXN1 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Szrd1Q6NXN1 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Szrd1Q6NXN1 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Szrd1Q6NXN1 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Szrd1Q6NXN1 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Szrd1Q6NXN1 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Szrd1Q6NXN1 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Szrd1Q6NXN1 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Szrd1Q6NXN1 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Szrd1Q6NXN1 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Szrd1Q6NXN1 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Szrd1Q6NXN1 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Szrd1Q6NXN1 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Szrd1Q6NXN1 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Szrd1Q6NXN1 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Szrd1Q6NXN1 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Szrd1Q6NXN1 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Szrd1Q6NXN1 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Szrd1Q6NXN1 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Szrd1Q6NXN1 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Szrd1Q6NXN1 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Szrd1Q6NXN1 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms