Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVD0

Frem2, FRAS1-related extracellular matrix protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 3,160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frem2Q6NVD0 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Frem2Q6NVD0 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Frem2Q6NVD0 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Frem2Q6NVD0 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Frem2Q6NVD0 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Frem2Q6NVD0 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Frem2Q6NVD0 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Frem2Q6NVD0 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Frem2Q6NVD0 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Frem2Q6NVD0 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Frem2Q6NVD0 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Frem2Q6NVD0 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Frem2Q6NVD0 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Frem2Q6NVD0 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Frem2Q6NVD0 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Frem2Q6NVD0 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Frem2Q6NVD0 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Frem2Q6NVD0 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Frem2Q6NVD0 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Frem2Q6NVD0 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Frem2Q6NVD0 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Frem2Q6NVD0 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Frem2Q6NVD0 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Frem2Q6NVD0 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Frem2Q6NVD0 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Frem2Q6NVD0 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Frem2Q6NVD0 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Frem2Q6NVD0 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Frem2Q6NVD0 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Frem2Q6NVD0 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Frem2Q6NVD0 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Frem2Q6NVD0 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Frem2Q6NVD0 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Frem2Q6NVD0 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Frem2Q6NVD0 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Frem2Q6NVD0 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Frem2Q6NVD0 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Frem2Q6NVD0 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Frem2Q6NVD0 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Frem2Q6NVD0 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Frem2Q6NVD0 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Frem2Q6NVD0 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Frem2Q6NVD0 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Frem2Q6NVD0 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Frem2Q6NVD0 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Frem2Q6NVD0 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Frem2Q6NVD0 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Frem2Q6NVD0 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Frem2Q6NVD0 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Frem2Q6NVD0 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Frem2Q6NVD0 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Frem2Q6NVD0 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Frem2Q6NVD0 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Frem2Q6NVD0 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Frem2Q6NVD0 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Frem2Q6NVD0 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Frem2Q6NVD0 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Frem2Q6NVD0 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Frem2Q6NVD0 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Frem2Q6NVD0 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Frem2Q6NVD0 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Frem2Q6NVD0 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Frem2Q6NVD0 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Frem2Q6NVD0 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Frem2Q6NVD0 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Frem2Q6NVD0 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Frem2Q6NVD0 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Frem2Q6NVD0 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Frem2Q6NVD0 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Frem2Q6NVD0 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Frem2Q6NVD0 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Frem2Q6NVD0 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Frem2Q6NVD0 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Frem2Q6NVD0 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Frem2Q6NVD0 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Frem2Q6NVD0 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Frem2Q6NVD0 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Frem2Q6NVD0 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Frem2Q6NVD0 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Frem2Q6NVD0 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Frem2Q6NVD0 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Frem2Q6NVD0 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Frem2Q6NVD0 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Frem2Q6NVD0 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Frem2Q6NVD0 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Frem2Q6NVD0 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Frem2Q6NVD0 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Frem2Q6NVD0 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Frem2Q6NVD0 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Frem2Q6NVD0 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Frem2Q6NVD0 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Frem2Q6NVD0 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Frem2Q6NVD0 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Frem2Q6NVD0 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Frem2Q6NVD0 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Frem2Q6NVD0 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Frem2Q6NVD0 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Frem2Q6NVD0 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Frem2Q6NVD0 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Frem2Q6NVD0 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms