Protein–RNA interactions for Protein: Q6IUP1

Sohlh1, Spermatogenesis- and oogenesis-specific basic helix-loop-helix-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sohlh1Q6IUP1 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sohlh1Q6IUP1 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sohlh1Q6IUP1 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sohlh1Q6IUP1 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sohlh1Q6IUP1 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sohlh1Q6IUP1 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sohlh1Q6IUP1 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sohlh1Q6IUP1 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sohlh1Q6IUP1 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Sohlh1Q6IUP1 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Sohlh1Q6IUP1 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sohlh1Q6IUP1 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sohlh1Q6IUP1 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sohlh1Q6IUP1 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sohlh1Q6IUP1 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sohlh1Q6IUP1 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sohlh1Q6IUP1 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sohlh1Q6IUP1 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sohlh1Q6IUP1 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sohlh1Q6IUP1 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sohlh1Q6IUP1 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sohlh1Q6IUP1 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sohlh1Q6IUP1 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sohlh1Q6IUP1 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sohlh1Q6IUP1 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sohlh1Q6IUP1 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sohlh1Q6IUP1 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sohlh1Q6IUP1 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sohlh1Q6IUP1 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sohlh1Q6IUP1 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sohlh1Q6IUP1 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sohlh1Q6IUP1 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sohlh1Q6IUP1 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sohlh1Q6IUP1 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sohlh1Q6IUP1 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sohlh1Q6IUP1 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sohlh1Q6IUP1 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sohlh1Q6IUP1 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sohlh1Q6IUP1 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sohlh1Q6IUP1 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sohlh1Q6IUP1 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sohlh1Q6IUP1 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sohlh1Q6IUP1 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sohlh1Q6IUP1 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sohlh1Q6IUP1 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sohlh1Q6IUP1 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sohlh1Q6IUP1 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sohlh1Q6IUP1 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sohlh1Q6IUP1 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sohlh1Q6IUP1 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sohlh1Q6IUP1 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sohlh1Q6IUP1 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sohlh1Q6IUP1 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sohlh1Q6IUP1 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sohlh1Q6IUP1 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sohlh1Q6IUP1 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sohlh1Q6IUP1 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sohlh1Q6IUP1 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sohlh1Q6IUP1 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sohlh1Q6IUP1 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sohlh1Q6IUP1 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sohlh1Q6IUP1 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sohlh1Q6IUP1 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sohlh1Q6IUP1 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sohlh1Q6IUP1 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sohlh1Q6IUP1 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sohlh1Q6IUP1 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sohlh1Q6IUP1 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sohlh1Q6IUP1 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sohlh1Q6IUP1 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Sohlh1Q6IUP1 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sohlh1Q6IUP1 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sohlh1Q6IUP1 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sohlh1Q6IUP1 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sohlh1Q6IUP1 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sohlh1Q6IUP1 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sohlh1Q6IUP1 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sohlh1Q6IUP1 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sohlh1Q6IUP1 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sohlh1Q6IUP1 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sohlh1Q6IUP1 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sohlh1Q6IUP1 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sohlh1Q6IUP1 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sohlh1Q6IUP1 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sohlh1Q6IUP1 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sohlh1Q6IUP1 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sohlh1Q6IUP1 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sohlh1Q6IUP1 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sohlh1Q6IUP1 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sohlh1Q6IUP1 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sohlh1Q6IUP1 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Sohlh1Q6IUP1 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Sohlh1Q6IUP1 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sohlh1Q6IUP1 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sohlh1Q6IUP1 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sohlh1Q6IUP1 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sohlh1Q6IUP1 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sohlh1Q6IUP1 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sohlh1Q6IUP1 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sohlh1Q6IUP1 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms