Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFT4

Arhgap20, Rho GTPase-activating protein 20, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgap20Q6IFT4 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Arhgap20Q6IFT4 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Arhgap20Q6IFT4 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Arhgap20Q6IFT4 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Arhgap20Q6IFT4 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Arhgap20Q6IFT4 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Arhgap20Q6IFT4 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Arhgap20Q6IFT4 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Arhgap20Q6IFT4 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Arhgap20Q6IFT4 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Arhgap20Q6IFT4 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Arhgap20Q6IFT4 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Arhgap20Q6IFT4 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Arhgap20Q6IFT4 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Arhgap20Q6IFT4 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Arhgap20Q6IFT4 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Arhgap20Q6IFT4 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Arhgap20Q6IFT4 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Arhgap20Q6IFT4 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Arhgap20Q6IFT4 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Arhgap20Q6IFT4 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Arhgap20Q6IFT4 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Arhgap20Q6IFT4 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Arhgap20Q6IFT4 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Arhgap20Q6IFT4 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Arhgap20Q6IFT4 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Arhgap20Q6IFT4 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Arhgap20Q6IFT4 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Arhgap20Q6IFT4 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Arhgap20Q6IFT4 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Arhgap20Q6IFT4 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Arhgap20Q6IFT4 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Arhgap20Q6IFT4 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Arhgap20Q6IFT4 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Arhgap20Q6IFT4 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Arhgap20Q6IFT4 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Arhgap20Q6IFT4 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Arhgap20Q6IFT4 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Arhgap20Q6IFT4 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Arhgap20Q6IFT4 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Arhgap20Q6IFT4 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Arhgap20Q6IFT4 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Arhgap20Q6IFT4 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Arhgap20Q6IFT4 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Arhgap20Q6IFT4 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Arhgap20Q6IFT4 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Arhgap20Q6IFT4 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Arhgap20Q6IFT4 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Arhgap20Q6IFT4 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Arhgap20Q6IFT4 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Arhgap20Q6IFT4 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Arhgap20Q6IFT4 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Arhgap20Q6IFT4 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Arhgap20Q6IFT4 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Arhgap20Q6IFT4 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Arhgap20Q6IFT4 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Arhgap20Q6IFT4 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Arhgap20Q6IFT4 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Arhgap20Q6IFT4 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Arhgap20Q6IFT4 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Arhgap20Q6IFT4 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Arhgap20Q6IFT4 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Arhgap20Q6IFT4 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Arhgap20Q6IFT4 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Arhgap20Q6IFT4 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Arhgap20Q6IFT4 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Arhgap20Q6IFT4 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Arhgap20Q6IFT4 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Arhgap20Q6IFT4 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Arhgap20Q6IFT4 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Arhgap20Q6IFT4 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Arhgap20Q6IFT4 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Arhgap20Q6IFT4 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Arhgap20Q6IFT4 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Arhgap20Q6IFT4 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Arhgap20Q6IFT4 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Arhgap20Q6IFT4 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Arhgap20Q6IFT4 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Arhgap20Q6IFT4 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Arhgap20Q6IFT4 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Arhgap20Q6IFT4 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Arhgap20Q6IFT4 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Arhgap20Q6IFT4 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Arhgap20Q6IFT4 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Arhgap20Q6IFT4 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Arhgap20Q6IFT4 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Arhgap20Q6IFT4 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Arhgap20Q6IFT4 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Arhgap20Q6IFT4 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Arhgap20Q6IFT4 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Arhgap20Q6IFT4 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Arhgap20Q6IFT4 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Arhgap20Q6IFT4 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Arhgap20Q6IFT4 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Arhgap20Q6IFT4 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Arhgap20Q6IFT4 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Arhgap20Q6IFT4 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Arhgap20Q6IFT4 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Arhgap20Q6IFT4 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Arhgap20Q6IFT4 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms