Protein–RNA interactions for Protein: Q6EDY6

Carmil1, F-actin-uncapping protein LRRC16A, mousemouse

Predictions only

Length 1,374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Carmil1Q6EDY6 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Carmil1Q6EDY6 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Carmil1Q6EDY6 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Carmil1Q6EDY6 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Carmil1Q6EDY6 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Carmil1Q6EDY6 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Carmil1Q6EDY6 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Carmil1Q6EDY6 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Carmil1Q6EDY6 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Carmil1Q6EDY6 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Carmil1Q6EDY6 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Carmil1Q6EDY6 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Carmil1Q6EDY6 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Carmil1Q6EDY6 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Carmil1Q6EDY6 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Carmil1Q6EDY6 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Carmil1Q6EDY6 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Carmil1Q6EDY6 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Carmil1Q6EDY6 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Carmil1Q6EDY6 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Carmil1Q6EDY6 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Carmil1Q6EDY6 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Carmil1Q6EDY6 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Carmil1Q6EDY6 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Carmil1Q6EDY6 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Carmil1Q6EDY6 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Carmil1Q6EDY6 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Carmil1Q6EDY6 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Carmil1Q6EDY6 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Carmil1Q6EDY6 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Carmil1Q6EDY6 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Carmil1Q6EDY6 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Carmil1Q6EDY6 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Carmil1Q6EDY6 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Carmil1Q6EDY6 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Carmil1Q6EDY6 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Carmil1Q6EDY6 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Carmil1Q6EDY6 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Carmil1Q6EDY6 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Carmil1Q6EDY6 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Carmil1Q6EDY6 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Carmil1Q6EDY6 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Carmil1Q6EDY6 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Carmil1Q6EDY6 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Carmil1Q6EDY6 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Carmil1Q6EDY6 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Carmil1Q6EDY6 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Carmil1Q6EDY6 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Carmil1Q6EDY6 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Carmil1Q6EDY6 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Carmil1Q6EDY6 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Carmil1Q6EDY6 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Carmil1Q6EDY6 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Carmil1Q6EDY6 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Carmil1Q6EDY6 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Carmil1Q6EDY6 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Carmil1Q6EDY6 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Carmil1Q6EDY6 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Carmil1Q6EDY6 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Carmil1Q6EDY6 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Carmil1Q6EDY6 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Carmil1Q6EDY6 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Carmil1Q6EDY6 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Carmil1Q6EDY6 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Carmil1Q6EDY6 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Carmil1Q6EDY6 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Carmil1Q6EDY6 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Carmil1Q6EDY6 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Carmil1Q6EDY6 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Carmil1Q6EDY6 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Carmil1Q6EDY6 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Carmil1Q6EDY6 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Carmil1Q6EDY6 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Carmil1Q6EDY6 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Carmil1Q6EDY6 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Carmil1Q6EDY6 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Carmil1Q6EDY6 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Carmil1Q6EDY6 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Carmil1Q6EDY6 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Carmil1Q6EDY6 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Carmil1Q6EDY6 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Carmil1Q6EDY6 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Carmil1Q6EDY6 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Carmil1Q6EDY6 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Carmil1Q6EDY6 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Carmil1Q6EDY6 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Carmil1Q6EDY6 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Carmil1Q6EDY6 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Carmil1Q6EDY6 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Carmil1Q6EDY6 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Carmil1Q6EDY6 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Carmil1Q6EDY6 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Carmil1Q6EDY6 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Carmil1Q6EDY6 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Carmil1Q6EDY6 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Carmil1Q6EDY6 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Carmil1Q6EDY6 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Carmil1Q6EDY6 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Carmil1Q6EDY6 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Carmil1Q6EDY6 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.4 ms