Protein–RNA interactions for Protein: Q69Z98

Brsk2, Serine/threonine-protein kinase BRSK2, mousemouse

Predictions only

Length 735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brsk2Q69Z98 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Brsk2Q69Z98 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Brsk2Q69Z98 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Brsk2Q69Z98 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Brsk2Q69Z98 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Brsk2Q69Z98 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Brsk2Q69Z98 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Brsk2Q69Z98 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Brsk2Q69Z98 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Brsk2Q69Z98 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Brsk2Q69Z98 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Brsk2Q69Z98 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Brsk2Q69Z98 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Brsk2Q69Z98 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Brsk2Q69Z98 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Brsk2Q69Z98 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Brsk2Q69Z98 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Brsk2Q69Z98 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Brsk2Q69Z98 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Brsk2Q69Z98 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Brsk2Q69Z98 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Brsk2Q69Z98 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Brsk2Q69Z98 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Brsk2Q69Z98 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Brsk2Q69Z98 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Brsk2Q69Z98 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Brsk2Q69Z98 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Brsk2Q69Z98 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Brsk2Q69Z98 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Brsk2Q69Z98 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Brsk2Q69Z98 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Brsk2Q69Z98 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Brsk2Q69Z98 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Brsk2Q69Z98 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Brsk2Q69Z98 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Brsk2Q69Z98 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Brsk2Q69Z98 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Brsk2Q69Z98 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Brsk2Q69Z98 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Brsk2Q69Z98 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Brsk2Q69Z98 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Brsk2Q69Z98 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Brsk2Q69Z98 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Brsk2Q69Z98 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Brsk2Q69Z98 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Brsk2Q69Z98 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Brsk2Q69Z98 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Brsk2Q69Z98 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Brsk2Q69Z98 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Brsk2Q69Z98 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Brsk2Q69Z98 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Brsk2Q69Z98 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Brsk2Q69Z98 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Brsk2Q69Z98 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Brsk2Q69Z98 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Brsk2Q69Z98 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Brsk2Q69Z98 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Brsk2Q69Z98 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Brsk2Q69Z98 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Brsk2Q69Z98 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Brsk2Q69Z98 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Brsk2Q69Z98 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Brsk2Q69Z98 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Brsk2Q69Z98 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Brsk2Q69Z98 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Brsk2Q69Z98 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Brsk2Q69Z98 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Brsk2Q69Z98 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Brsk2Q69Z98 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Brsk2Q69Z98 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Brsk2Q69Z98 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Brsk2Q69Z98 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Brsk2Q69Z98 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Brsk2Q69Z98 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Brsk2Q69Z98 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Brsk2Q69Z98 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Brsk2Q69Z98 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Brsk2Q69Z98 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Brsk2Q69Z98 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Brsk2Q69Z98 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Brsk2Q69Z98 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Brsk2Q69Z98 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Brsk2Q69Z98 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Brsk2Q69Z98 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Brsk2Q69Z98 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Brsk2Q69Z98 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Brsk2Q69Z98 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Brsk2Q69Z98 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Brsk2Q69Z98 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Brsk2Q69Z98 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Brsk2Q69Z98 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Brsk2Q69Z98 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Brsk2Q69Z98 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Brsk2Q69Z98 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Brsk2Q69Z98 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Brsk2Q69Z98 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Brsk2Q69Z98 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Brsk2Q69Z98 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Brsk2Q69Z98 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Brsk2Q69Z98 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms