Protein–RNA interactions for Protein: Q68FE8

Znf280d, Zinc finger protein 280D, mousemouse

Predictions only

Length 974 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf280dQ68FE8 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Znf280dQ68FE8 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Znf280dQ68FE8 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Znf280dQ68FE8 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Znf280dQ68FE8 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Znf280dQ68FE8 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Znf280dQ68FE8 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Znf280dQ68FE8 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Znf280dQ68FE8 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Znf280dQ68FE8 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Znf280dQ68FE8 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Znf280dQ68FE8 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Znf280dQ68FE8 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Znf280dQ68FE8 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Znf280dQ68FE8 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Znf280dQ68FE8 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Znf280dQ68FE8 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Znf280dQ68FE8 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Znf280dQ68FE8 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Znf280dQ68FE8 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Znf280dQ68FE8 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Znf280dQ68FE8 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Znf280dQ68FE8 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Znf280dQ68FE8 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Znf280dQ68FE8 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Znf280dQ68FE8 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Znf280dQ68FE8 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Znf280dQ68FE8 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Znf280dQ68FE8 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Znf280dQ68FE8 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Znf280dQ68FE8 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Znf280dQ68FE8 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Znf280dQ68FE8 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Znf280dQ68FE8 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Znf280dQ68FE8 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Znf280dQ68FE8 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Znf280dQ68FE8 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Znf280dQ68FE8 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Znf280dQ68FE8 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Znf280dQ68FE8 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Znf280dQ68FE8 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Znf280dQ68FE8 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Znf280dQ68FE8 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Znf280dQ68FE8 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Znf280dQ68FE8 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Znf280dQ68FE8 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Znf280dQ68FE8 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Znf280dQ68FE8 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Znf280dQ68FE8 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Znf280dQ68FE8 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Znf280dQ68FE8 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Znf280dQ68FE8 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Znf280dQ68FE8 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Znf280dQ68FE8 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Znf280dQ68FE8 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Znf280dQ68FE8 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Znf280dQ68FE8 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Znf280dQ68FE8 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Znf280dQ68FE8 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Znf280dQ68FE8 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Znf280dQ68FE8 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Znf280dQ68FE8 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Znf280dQ68FE8 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Znf280dQ68FE8 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Znf280dQ68FE8 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Znf280dQ68FE8 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Znf280dQ68FE8 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Znf280dQ68FE8 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Znf280dQ68FE8 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Znf280dQ68FE8 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Znf280dQ68FE8 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Znf280dQ68FE8 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Znf280dQ68FE8 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Znf280dQ68FE8 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Znf280dQ68FE8 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Znf280dQ68FE8 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Znf280dQ68FE8 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Znf280dQ68FE8 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Znf280dQ68FE8 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Znf280dQ68FE8 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Znf280dQ68FE8 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Znf280dQ68FE8 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Znf280dQ68FE8 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Znf280dQ68FE8 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Znf280dQ68FE8 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Znf280dQ68FE8 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Znf280dQ68FE8 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Znf280dQ68FE8 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Znf280dQ68FE8 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Znf280dQ68FE8 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Znf280dQ68FE8 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Znf280dQ68FE8 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Znf280dQ68FE8 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Znf280dQ68FE8 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Znf280dQ68FE8 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Znf280dQ68FE8 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Znf280dQ68FE8 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Znf280dQ68FE8 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Znf280dQ68FE8 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Znf280dQ68FE8 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms