Protein–RNA interactions for Protein: Q68EF0

Rab3ip, Rab-3A-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3ipQ68EF0 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab3ipQ68EF0 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab3ipQ68EF0 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab3ipQ68EF0 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab3ipQ68EF0 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab3ipQ68EF0 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab3ipQ68EF0 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab3ipQ68EF0 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab3ipQ68EF0 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab3ipQ68EF0 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab3ipQ68EF0 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab3ipQ68EF0 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab3ipQ68EF0 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab3ipQ68EF0 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab3ipQ68EF0 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab3ipQ68EF0 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab3ipQ68EF0 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab3ipQ68EF0 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab3ipQ68EF0 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab3ipQ68EF0 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab3ipQ68EF0 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab3ipQ68EF0 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab3ipQ68EF0 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab3ipQ68EF0 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab3ipQ68EF0 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab3ipQ68EF0 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab3ipQ68EF0 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab3ipQ68EF0 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab3ipQ68EF0 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab3ipQ68EF0 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab3ipQ68EF0 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab3ipQ68EF0 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab3ipQ68EF0 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab3ipQ68EF0 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab3ipQ68EF0 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab3ipQ68EF0 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab3ipQ68EF0 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab3ipQ68EF0 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab3ipQ68EF0 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab3ipQ68EF0 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab3ipQ68EF0 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab3ipQ68EF0 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab3ipQ68EF0 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab3ipQ68EF0 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab3ipQ68EF0 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab3ipQ68EF0 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab3ipQ68EF0 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab3ipQ68EF0 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab3ipQ68EF0 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab3ipQ68EF0 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab3ipQ68EF0 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab3ipQ68EF0 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab3ipQ68EF0 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab3ipQ68EF0 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab3ipQ68EF0 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab3ipQ68EF0 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab3ipQ68EF0 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab3ipQ68EF0 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab3ipQ68EF0 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab3ipQ68EF0 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab3ipQ68EF0 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab3ipQ68EF0 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab3ipQ68EF0 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab3ipQ68EF0 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab3ipQ68EF0 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab3ipQ68EF0 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab3ipQ68EF0 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab3ipQ68EF0 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab3ipQ68EF0 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab3ipQ68EF0 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab3ipQ68EF0 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab3ipQ68EF0 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab3ipQ68EF0 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab3ipQ68EF0 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab3ipQ68EF0 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab3ipQ68EF0 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab3ipQ68EF0 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab3ipQ68EF0 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab3ipQ68EF0 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab3ipQ68EF0 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab3ipQ68EF0 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab3ipQ68EF0 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab3ipQ68EF0 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab3ipQ68EF0 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab3ipQ68EF0 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab3ipQ68EF0 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab3ipQ68EF0 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab3ipQ68EF0 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab3ipQ68EF0 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab3ipQ68EF0 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab3ipQ68EF0 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab3ipQ68EF0 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab3ipQ68EF0 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab3ipQ68EF0 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab3ipQ68EF0 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab3ipQ68EF0 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab3ipQ68EF0 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab3ipQ68EF0 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab3ipQ68EF0 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab3ipQ68EF0 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 108.9 ms