Protein–RNA interactions for Protein: Q66JT1

Lrrc8e, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8E, mousemouse

Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc8eQ66JT1 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrrc8eQ66JT1 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrrc8eQ66JT1 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrrc8eQ66JT1 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrrc8eQ66JT1 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrrc8eQ66JT1 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrrc8eQ66JT1 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrrc8eQ66JT1 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrrc8eQ66JT1 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrrc8eQ66JT1 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrrc8eQ66JT1 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrrc8eQ66JT1 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrrc8eQ66JT1 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrrc8eQ66JT1 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrrc8eQ66JT1 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrrc8eQ66JT1 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrrc8eQ66JT1 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrrc8eQ66JT1 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrrc8eQ66JT1 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrrc8eQ66JT1 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrrc8eQ66JT1 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrrc8eQ66JT1 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrrc8eQ66JT1 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrrc8eQ66JT1 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrrc8eQ66JT1 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrrc8eQ66JT1 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrrc8eQ66JT1 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrrc8eQ66JT1 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrrc8eQ66JT1 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrrc8eQ66JT1 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrrc8eQ66JT1 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrrc8eQ66JT1 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrrc8eQ66JT1 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrrc8eQ66JT1 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrrc8eQ66JT1 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrrc8eQ66JT1 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrrc8eQ66JT1 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrrc8eQ66JT1 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrrc8eQ66JT1 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrrc8eQ66JT1 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrrc8eQ66JT1 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrrc8eQ66JT1 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrrc8eQ66JT1 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrrc8eQ66JT1 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrrc8eQ66JT1 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrrc8eQ66JT1 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrrc8eQ66JT1 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrrc8eQ66JT1 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrrc8eQ66JT1 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrrc8eQ66JT1 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrrc8eQ66JT1 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrrc8eQ66JT1 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrrc8eQ66JT1 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrrc8eQ66JT1 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrrc8eQ66JT1 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrrc8eQ66JT1 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrrc8eQ66JT1 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrrc8eQ66JT1 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrrc8eQ66JT1 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrrc8eQ66JT1 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrrc8eQ66JT1 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrrc8eQ66JT1 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrrc8eQ66JT1 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrrc8eQ66JT1 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrrc8eQ66JT1 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrrc8eQ66JT1 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrrc8eQ66JT1 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrrc8eQ66JT1 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrrc8eQ66JT1 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrrc8eQ66JT1 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrrc8eQ66JT1 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrrc8eQ66JT1 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrrc8eQ66JT1 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrrc8eQ66JT1 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrrc8eQ66JT1 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrrc8eQ66JT1 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrrc8eQ66JT1 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrrc8eQ66JT1 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrrc8eQ66JT1 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrrc8eQ66JT1 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrrc8eQ66JT1 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrrc8eQ66JT1 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrrc8eQ66JT1 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lrrc8eQ66JT1 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lrrc8eQ66JT1 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lrrc8eQ66JT1 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lrrc8eQ66JT1 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lrrc8eQ66JT1 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lrrc8eQ66JT1 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lrrc8eQ66JT1 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lrrc8eQ66JT1 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lrrc8eQ66JT1 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lrrc8eQ66JT1 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lrrc8eQ66JT1 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lrrc8eQ66JT1 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lrrc8eQ66JT1 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lrrc8eQ66JT1 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lrrc8eQ66JT1 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lrrc8eQ66JT1 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lrrc8eQ66JT1 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms