Protein–RNA interactions for Protein: Q64127

Trim24, Transcription intermediary factor 1-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim24Q64127 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim24Q64127 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim24Q64127 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim24Q64127 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim24Q64127 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim24Q64127 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim24Q64127 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim24Q64127 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim24Q64127 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim24Q64127 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim24Q64127 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim24Q64127 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim24Q64127 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim24Q64127 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim24Q64127 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim24Q64127 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim24Q64127 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim24Q64127 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim24Q64127 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim24Q64127 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim24Q64127 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim24Q64127 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim24Q64127 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim24Q64127 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim24Q64127 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim24Q64127 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim24Q64127 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim24Q64127 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim24Q64127 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim24Q64127 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim24Q64127 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim24Q64127 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim24Q64127 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim24Q64127 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim24Q64127 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim24Q64127 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim24Q64127 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim24Q64127 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim24Q64127 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim24Q64127 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim24Q64127 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim24Q64127 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim24Q64127 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim24Q64127 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim24Q64127 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim24Q64127 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim24Q64127 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim24Q64127 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim24Q64127 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim24Q64127 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim24Q64127 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim24Q64127 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim24Q64127 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim24Q64127 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim24Q64127 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim24Q64127 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim24Q64127 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim24Q64127 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim24Q64127 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim24Q64127 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim24Q64127 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim24Q64127 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim24Q64127 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim24Q64127 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim24Q64127 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim24Q64127 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim24Q64127 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim24Q64127 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim24Q64127 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim24Q64127 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim24Q64127 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim24Q64127 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim24Q64127 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim24Q64127 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim24Q64127 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim24Q64127 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim24Q64127 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim24Q64127 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim24Q64127 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim24Q64127 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim24Q64127 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim24Q64127 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim24Q64127 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim24Q64127 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim24Q64127 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim24Q64127 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim24Q64127 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim24Q64127 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim24Q64127 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim24Q64127 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim24Q64127 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim24Q64127 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim24Q64127 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim24Q64127 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim24Q64127 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim24Q64127 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim24Q64127 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim24Q64127 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim24Q64127 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim24Q64127 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms