Protein–RNA interactions for Protein: Q640Q5

Pan3, PAN2-PAN3 deadenylation complex subunit Pan3, mousemouse

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pan3Q640Q5 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pan3Q640Q5 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pan3Q640Q5 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pan3Q640Q5 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pan3Q640Q5 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pan3Q640Q5 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pan3Q640Q5 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pan3Q640Q5 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pan3Q640Q5 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pan3Q640Q5 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pan3Q640Q5 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pan3Q640Q5 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pan3Q640Q5 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pan3Q640Q5 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pan3Q640Q5 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pan3Q640Q5 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pan3Q640Q5 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pan3Q640Q5 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pan3Q640Q5 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pan3Q640Q5 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pan3Q640Q5 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pan3Q640Q5 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pan3Q640Q5 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pan3Q640Q5 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pan3Q640Q5 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pan3Q640Q5 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pan3Q640Q5 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pan3Q640Q5 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pan3Q640Q5 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Pan3Q640Q5 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pan3Q640Q5 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pan3Q640Q5 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pan3Q640Q5 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pan3Q640Q5 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pan3Q640Q5 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pan3Q640Q5 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pan3Q640Q5 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pan3Q640Q5 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pan3Q640Q5 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pan3Q640Q5 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pan3Q640Q5 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pan3Q640Q5 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pan3Q640Q5 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pan3Q640Q5 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pan3Q640Q5 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pan3Q640Q5 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pan3Q640Q5 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pan3Q640Q5 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pan3Q640Q5 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pan3Q640Q5 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pan3Q640Q5 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pan3Q640Q5 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pan3Q640Q5 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pan3Q640Q5 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pan3Q640Q5 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pan3Q640Q5 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pan3Q640Q5 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pan3Q640Q5 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pan3Q640Q5 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pan3Q640Q5 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pan3Q640Q5 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pan3Q640Q5 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pan3Q640Q5 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pan3Q640Q5 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pan3Q640Q5 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pan3Q640Q5 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Pan3Q640Q5 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pan3Q640Q5 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pan3Q640Q5 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pan3Q640Q5 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pan3Q640Q5 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pan3Q640Q5 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pan3Q640Q5 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Pan3Q640Q5 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pan3Q640Q5 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pan3Q640Q5 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pan3Q640Q5 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pan3Q640Q5 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pan3Q640Q5 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pan3Q640Q5 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pan3Q640Q5 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pan3Q640Q5 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Pan3Q640Q5 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pan3Q640Q5 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pan3Q640Q5 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pan3Q640Q5 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pan3Q640Q5 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pan3Q640Q5 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pan3Q640Q5 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Pan3Q640Q5 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pan3Q640Q5 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pan3Q640Q5 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pan3Q640Q5 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pan3Q640Q5 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pan3Q640Q5 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Pan3Q640Q5 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pan3Q640Q5 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pan3Q640Q5 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Pan3Q640Q5 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pan3Q640Q5 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms