Protein–RNA interactions for Protein: Q62383

Supt6h, Transcription elongation factor SPT6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Supt6hQ62383 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Supt6hQ62383 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Supt6hQ62383 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Supt6hQ62383 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Supt6hQ62383 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Supt6hQ62383 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Supt6hQ62383 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Supt6hQ62383 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Supt6hQ62383 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Supt6hQ62383 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Supt6hQ62383 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Supt6hQ62383 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Supt6hQ62383 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Supt6hQ62383 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Supt6hQ62383 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Supt6hQ62383 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Supt6hQ62383 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Supt6hQ62383 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Supt6hQ62383 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Supt6hQ62383 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Supt6hQ62383 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Supt6hQ62383 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Supt6hQ62383 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Supt6hQ62383 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Supt6hQ62383 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Supt6hQ62383 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Supt6hQ62383 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Supt6hQ62383 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Supt6hQ62383 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Supt6hQ62383 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Supt6hQ62383 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Supt6hQ62383 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Supt6hQ62383 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Supt6hQ62383 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Supt6hQ62383 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Supt6hQ62383 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Supt6hQ62383 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Supt6hQ62383 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Supt6hQ62383 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Supt6hQ62383 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Supt6hQ62383 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Supt6hQ62383 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Supt6hQ62383 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Supt6hQ62383 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Supt6hQ62383 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Supt6hQ62383 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Supt6hQ62383 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Supt6hQ62383 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Supt6hQ62383 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Supt6hQ62383 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Supt6hQ62383 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Supt6hQ62383 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Supt6hQ62383 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Supt6hQ62383 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Supt6hQ62383 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Supt6hQ62383 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Supt6hQ62383 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Supt6hQ62383 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Supt6hQ62383 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Supt6hQ62383 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Supt6hQ62383 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Supt6hQ62383 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Supt6hQ62383 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Supt6hQ62383 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Supt6hQ62383 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Supt6hQ62383 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Supt6hQ62383 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Supt6hQ62383 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Supt6hQ62383 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Supt6hQ62383 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Supt6hQ62383 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Supt6hQ62383 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Supt6hQ62383 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Supt6hQ62383 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
Supt6hQ62383 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Supt6hQ62383 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Supt6hQ62383 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Supt6hQ62383 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Supt6hQ62383 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Supt6hQ62383 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Supt6hQ62383 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Supt6hQ62383 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Supt6hQ62383 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Supt6hQ62383 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Supt6hQ62383 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Supt6hQ62383 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Supt6hQ62383 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Supt6hQ62383 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Supt6hQ62383 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Supt6hQ62383 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Supt6hQ62383 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Supt6hQ62383 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Supt6hQ62383 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Supt6hQ62383 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Supt6hQ62383 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Supt6hQ62383 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Supt6hQ62383 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Supt6hQ62383 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Supt6hQ62383 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Supt6hQ62383 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms